RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	WDR82	Q6UXN9	313 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF488	Q96MN9	340 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	DECR2	Q9NUI1	292 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	TREM2	Q9NZC2	230 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780		A6NLC8	198 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780		F8VVB4	439 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780		F8VWA3	439 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	SSX4	O60224	188 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM225B	P0DP42	221 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	MNDA	P41218	407 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	PITPNB	P48739	271 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	ASCL4	Q6XD76	172 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	BATF2	Q8N1L9	274 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	SLAMF9	Q96A28	289 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		18.81	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	BPNT1	O95861	308 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	IL24	Q13007	206 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	AWAT2	Q6E213	333 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	OR51F2	Q8NH61	342 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A0G2JMP0	313 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A0X1KG70	313 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	ARSB	P15848	533 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	TNFRSF1A	P19438	455 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	NPBWR2	P48146	333 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	QRFP	P83859	136 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	PLA2G7	Q13093	441 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	IL18	Q14116	193 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	STEAP3	Q658P3	488 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	PXT1	Q8NFP0	134 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780		Q8TCH9	128 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780		A0A1W2PP11	408 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	CDC14B	O60729	498 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	HLA-DQB1	P01920	261 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	SFTPB	P07988	381 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	EGR1	P18146	543 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	RAB6A	P20340	208 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	PYDC2	Q56P42	97 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	OR10K2	Q6IF99	312 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	YIPF5	Q969M3	257 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	DLL4	Q9NR61	685 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	ING4	Q9UNL4	249 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	CTDSPL	O15194	276 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	PGA5	P0DJD9	388 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	LYNX1	P0DP58	116 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	IL7	P13232	177 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	BCL3	P20749	454 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	ERVK11-1	P61568	191 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	BAK1	Q16611	211 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF525	Q8N782	197 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FAM53B-201	ENST00000280780	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	AKR7A2	O43488	359 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	KDM4B	O94953	1096 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	CSF3	P09919	207 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	UBB	P0CG47	229 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	VSIG8	P0DPA2	414 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	COL8A2	P25067	703 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	PITPNA	Q00169	270 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	UNC119	Q13432	240 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	RGS21	Q2M5E4	152 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	MKX	Q8IYA7	352 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM104	Q8NE00	496 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	LRRC29	Q8WV35	223 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	ERGIC1	Q969X5	290 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FAM53B-201	ENST00000280780	ABHD1	Q96SE0	405 aa		18.76	■□□□□ 0.59

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