RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRO1933Q9H354 126 aa18.51■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 WNT16Q9UBV4 365 aa18.51■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 LIPGQ9Y5X9 500 aa18.51■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 POMT1Q9Y6A1 747 aa18.51■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLA2G5P39877 138 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 RUNX1Q01196 453 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 HEPN1Q6WQI6 88 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 DOK3Q7L591 496 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 Q8WTZ3 238 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB39BQ96DA2 213 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TCEAL7Q9BRU2 100 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANXA10Q9UJ72 324 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF43P17038 809 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSC22D1Q15714 1073 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 THEM4Q5T1C6 240 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM217Q8N7C4 229 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR10G3Q8NGC4 313 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SSC4DQ8WTU2 575 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR61Q9BZJ8 451 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF407Q9C0G0 2248 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 E5RGE8 158 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF728P0DKX0 622 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 P2RY1P47900 373 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 RGS19P49795 217 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF84P51523 738 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 STARD6P59095 220 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERVFRD-1P60508 538 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM187Q14656 261 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIGYQ3MUY2 71 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC38A9Q8NBW4 561 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALKBH4Q9NXW9 302 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 NSG2Q9Y328 171 aa18.5■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1W2PPC4 97 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLDN17P56750 224 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TLE1Q04724 770 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 HMGN3Q15651 99 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRAMEF20Q5VT98 475 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 H3BQ15 152 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFNA17P01571 189 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPINK2P20155 84 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 FASLGP48023 281 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 C17orf67Q0P5P2 114 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNAI3Q3KNW1 292 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 NTNG2Q96CW9 530 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa18.49■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 CST7O76096 145 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEC11BP0C7V7 166 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHATP28329 748 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 GINS3Q9BRX5 216 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM86C1Q9NVL1 165 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1B0GV90 55 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC22A25Q6T423 547 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR2G3Q8NGZ4 309 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 MUCL1Q96DR8 90 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAA60Q9H7X0 242 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TUBA4BQ9H853 241 aa18.48■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 MTCP1P56278 107 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC54Q8NEL0 328 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ST8SIA1Q92185 356 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLEKHA2Q9HB19 425 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC2A9Q9NRM0 540 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR137BO60478 399 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 PATE4P0C8F1 98 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SRFP11831 508 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 BLKP51451 505 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TP53RKQ96S44 253 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARV1Q9H2C2 271 aa18.47■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SOD3P08294 240 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 HOXA5P20719 270 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP6V0CP27449 155 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 RND3P61587 244 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 RHEBQ15382 184 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC35G3Q8N808 338 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 S100PBPQ96BU1 408 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 YPEL4Q96NS1 127 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 SERPINE3A8MV23 424 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 G3V3Y1 287 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRGC2P03986 189 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 EPHA1P21709 976 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBE2KP61086 200 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM171Q8WVE6 324 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 MEGF10Q96KG7 1140 aa18.46■□□□□ 0.55
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130 ms