RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 EHFQ9NZC4 300 aa13.97□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 SPRR3Q9UBC9 169 aa13.97□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 ZNF587BE7ETH6 402 aa13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 ZNF205O95201 554 aa13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 SFT2D2O95562 160 aa13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 OR3A2P47893 321 aa13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 VAX1Q5SQQ9 334 aa13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 APH1AQ96BI3 265 aa13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 OCSTAMPQ9BR26 566 aa13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 ACKR4Q9NPB9 350 aa13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 ANAPC10Q9UM13 185 aa13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
GINS2-201ENST00000253462 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 WISP2O76076 250 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 KNG1P01042 644 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 HOXB5P09067 269 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 ZNF92Q03936 586 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 C6orf201Q7Z4U5 140 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 ZNF100Q8IYN0 542 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 TMEM178AQ8NBL3 297 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 S100A13Q99584 98 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 GSKIPQ9P0R6 139 aa13.96□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 MTCP1P56278 107 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 TAS2R31P59538 309 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 PECRQ9BY49 303 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 BCO1Q9HAY6 547 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 OR2S2Q9NQN1 319 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 MGAQ8IWI9 3026 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 GPR31O00270 319 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 ANGPTL7O43827 346 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 ACTL6AO96019 429 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 GABRR1P24046 479 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 ARRDC1Q8N5I2 433 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 MARC2Q969Z3 335 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 PHYHIPLQ96FC7 376 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 WDYHV1Q96HA8 205 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 DNTTIP1Q9H147 329 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 GLS2Q9UI32 602 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 PRSS50Q9UI38 385 aa13.95□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 TOR1AO14656 332 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 CD79AP11912 226 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 SOX8P57073 446 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 TMEM17Q86X19 198 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 LINC00470Q9BZP3 86 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 NMES1Q9C002 83 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 TMEM231Q9H6L2 316 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 OSGIN2Q9Y236 505 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 DSPP15924 2871 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 A0A1B0GW55 424 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 DUX4L2P0CJ85 424 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 DUX4L3P0CJ86 424 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 DUX4L4P0CJ87 422 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 DUX4L5P0CJ88 424 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 DUX4L6P0CJ89 424 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 DUX4L7P0CJ90 424 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 TMEM225BP0DP42 221 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 EDN3P14138 238 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 NUBP1P53384 320 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 RAB32Q13637 225 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 NKAPLQ5M9Q1 402 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 FAM89BQ8N5H3 189 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 DUX4Q9UBX2 424 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 LHX6Q9UPM6 363 aa13.94□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 F12P00748 615 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 FPR2P25090 351 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 FAM3AP98173 230 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 Q6ZSR3 168 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 LHFPL1Q86WI0 220 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 C5orf49A4QMS7 147 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 ZNF724A8MTY0 619 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 NAT2P11245 290 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 RPS2P15880 293 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 ADCYAP1P18509 176 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 S100A10P60903 97 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 GUCA2BQ16661 112 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 BAP18Q8IXM2 172 aa13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa13.92□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 DHRS7CA6NNS2 312 aa13.92□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 F8VVB4 439 aa13.92□□□□□ -0.18
GINS2-201ENST00000253462 F8VWA3 439 aa13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms