RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 IL13RA1P78552 427 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 KISS1Q15726 138 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 Q499Y3 187 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 MKXQ8IYA7 352 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 ST8SIA4Q92187 359 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 PIN1P1O15428 100 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 ANGPTL7O43827 346 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 ECDO95905 644 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 KNG1P01042 644 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 CD2P06729 351 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 RAB3AP20336 220 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 BCL3P20749 454 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 SRP14P37108 136 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 BTNL3Q6UXE8 466 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 OR52N4Q8NGI2 321 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 OR5D18Q8NGL1 313 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 IL36RNQ9UBH0 155 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 NKX6-3A6NJ46 265 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 ENSAO43768 121 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 ALDOBP05062 364 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 PPIAL4GP0DN37 164 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 MMP9P14780 707 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 MAP2K4P45985 399 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 CAV3P56539 151 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 LRRC10Q5BKY1 277 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 C8orf46Q8TAG6 207 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 OR14A2Q96R54 314 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 DCTN5Q9BTE1 182 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPK0 400 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 GPR37O15354 613 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 KDM4BO94953 1096 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 SFTPBP07988 381 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 HCKP08631 526 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 INSL4Q14641 139 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 MED22Q15528 200 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 SAXO1Q8IYX7 474 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 NANPQ8TBE9 248 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 UPRTQ96BW1 309 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 DERL3Q96Q80 235 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 MRI1Q9BV20 369 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 ATRQ13535 2644 aa18.4■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA13PA6NCF6 341 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ZNF879B4DU55 563 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 LIPFP07098 398 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 CALCBP10092 127 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 GP2P55259 537 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 FGF12P61328 243 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TUSC1Q2TAM9 212 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 FAM58AQ8N1B3 248 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ZNF561Q8N587 486 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 CCDC90BQ9GZT6 254 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 CNTD2Q9H8S5 307 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 HMG20AQ9NP66 347 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 OR14J1Q9UGF5 321 aa18.39■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 GABRPO00591 440 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ZNF737O75373 536 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 SC5DO75845 299 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 FSTP19883 344 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 GPR50Q13585 617 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TPBGQ13641 420 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ZNF146Q15072 292 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ASCL4Q6XD76 172 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 Q8IYB0 196 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TBX15Q96SF7 602 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 SIRPDQ9H106 197 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 NEK6Q9HC98 313 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ISYNA1Q9NPH2 558 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TMEM138Q9NPI0 162 aa18.38■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa18.37■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TGFBR2P37173 567 aa18.37■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 ARF6P62330 175 aa18.37■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 COL10A1Q03692 680 aa18.37■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 LYPD6Q86Y78 171 aa18.37■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TEX29Q8N6K0 151 aa18.37■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TMEM185AQ8NFB2 350 aa18.37■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 DMRTB1Q96MA1 342 aa18.37■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 Q9H521 79 aa18.37■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 NOX4Q9NPH5 578 aa18.37■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TMEM82A0PJX8 343 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 K7N7A8 449 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 CYB5AP00167 134 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TK1P04183 234 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 TMEM225BP0DP42 221 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 NDUFB7P17568 137 aa18.36■□□□□ 0.53
SYF2-201ENST00000236273 DUSP1P28562 367 aa18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms