RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640393.1

RTTN-217, Transcript of rotatin, humanhuman

TSL 5

Gene RTTN, Length 1,357 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTTN-217ENST00000640393 C9orf72Q96LT7 481 aa2.6□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 GLT1D1Q96MS3 346 aa2.6□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 TMEM175Q9BSA9 504 aa2.6□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 REEP1Q9H902 201 aa2.6□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 SPACA1Q9HBV2 294 aa2.6□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 RAB22AQ9UL26 194 aa2.6□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 PCNX2A6NKB5 2137 aa2.59□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 STRCQ7RTU9 1775 aa2.59□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 CFAP43Q8NDM7 1665 aa2.59□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa2.59□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 NEURL4Q96JN8 1562 aa2.59□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 ABCC2Q92887 1545 aa2.59□□□□□ -1.99
RTTN-217ENST00000640393 TMEM94Q12767 1356 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SLC22A20A6NK97 555 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 RFXANKO14593 260 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CETN3O15182 167 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 GMDSO60547 372 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CTNSO60931 367 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 IGKV1-39P01597 117 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 IGKV1D-39P04432 117 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 NELFEP18615 380 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 OR2B8PP59922 312 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CCL15Q16663 113 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PDPK2PQ6A1A2 396 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ERICH5Q6P6B1 374 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PDPNQ86YL7 162 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 BBS7Q8IWZ6 715 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ZNF664Q8N3J9 261 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 Q96MT0 163 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 RDH12Q96NR8 316 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 AGMATQ9BSE5 352 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 BBS2Q9BXC9 721 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 RAB1BQ9H0U4 201 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ANKHQ9HCJ1 492 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 HEBP1Q9NRV9 189 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CA10Q9NS85 328 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 GMEB1Q9Y692 573 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 VWA8A3KMH1 1905 aa2.59□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ERICH2A1L162 156 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 GOLGA8JA6NMD2 632 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 GOLGA8HP0CJ92 632 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ZNF35P13682 527 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 IL3RAP26951 378 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 HLA-DMAP28067 261 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 INCA1Q0VD86 236 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 DEFB134Q4QY38 66 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TMEM69Q5SWH9 247 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CCDC122Q5T0U0 273 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 HHATQ5VTY9 493 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 LINC00336Q6ZUF6 198 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 COPS6Q7L5N1 327 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PID1Q7Z2X4 250 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ACBD6Q9BR61 282 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 DEFB129Q9H1M3 183 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa2.58□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CUX1P39880 1505 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 IQSEC2Q5JU85 1478 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 TMEM131Q92545 1883 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PREX1Q8TCU6 1659 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 MYL12BO14950 172 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PSPHP1O15172 72 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PLEKHA8P1O95397 391 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 NRASP01111 189 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 HRASP01112 189 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 KRASP01116 189 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 NQO2P16083 231 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PAFAH1B2P68402 229 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 KDSRQ06136 332 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 COMTD1Q86VU5 262 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 FAM9CQ8IZT9 166 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 OR1S1Q8NH92 325 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SUN5Q8TC36 379 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 BEX2Q9BXY8 128 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 STMN3Q9NZ72 180 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 POFUT2Q9Y2G5 429 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 AK9Q5TCS8 1911 aa2.57□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PLXNB1O43157 2135 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 FHAD1B1AJZ9 1412 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 PTPRGP23470 1445 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 A0A1B0GW15 77 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 MGAT4DA6NG13 374 aa2.56□□□□□ -2
RTTN-217ENST00000640393 SC5DO75845 299 aa2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms