RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637243.1

CHRNA4-218, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 85 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-218ENST00000637243 UBE2QL1A1L167 161 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 POM121CA8CG34 1229 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 HMSDA8MTL9 139 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 G3V3Q6 166 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 PLPP3O14495 311 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 LDLRAD4O15165 306 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 SSNA1O43805 119 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 RBBP9O75884 186 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 SLC22A5O76082 557 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 OR6A2O95222 327 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 IGLV1-44P01699 117 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 MT-ND4P03905 459 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 F13BP05160 661 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 CXCL3P19876 107 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 RAB6AP20340 208 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 M6PRP20645 277 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 CDK2P24941 298 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 GRPRP30550 384 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 KIR3DL2P43630 455 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 GSK3AP49840 483 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 MMP16P51512 607 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 CCR6P51684 374 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 RIDAP52758 137 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 ZP1P60852 638 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 MADCAM1Q13477 382 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 FAM189A2Q15884 450 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 RAB11BQ15907 218 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 MEP1BQ16820 701 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 ESCO2Q56NI9 601 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 C1orf100Q5SVJ3 147 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 C6orf183Q5T699 404 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 TMEM244Q5VVB8 128 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 ASPHD2Q6ICH7 369 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 RAB12Q6IQ22 244 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 TMPPEQ6ZT21 453 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 DOK3Q7L591 496 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 DPY19L4Q7Z388 723 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 SYT9Q86SS6 491 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 LYPD6Q86Y78 171 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 SLC26A10Q8NG04 563 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 OR51F2Q8NH61 342 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 GPX8Q8TED1 209 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 THEM6Q8WUY1 208 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 ASB10Q8WXI3 467 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 TSSK2Q96PF2 358 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 CITED1Q99966 193 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 TTTY10Q9BZA0 68 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 ELOVL3Q9HB03 270 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 NOX3Q9HBY0 568 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 MED9Q9NWA0 146 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 UPB1Q9UBR1 384 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 FBLN5Q9UBX5 448 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF69Q9UC07 566 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 KIF25Q9UIL4 384 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF222Q9UK12 451 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 MGAT4AQ9UM21 535 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 HHLA2Q9UM44 414 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 DHDHQ9UQ10 334 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 PLXNB1O43157 2135 aa4.99□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 LYSTQ99698 3801 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 A0A0B4J203 849 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 PLSCR5A0PG75 271 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 TVP23AA6NH52 213 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 A6NIN4 97 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 M0R233 179 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 SHOXO15266 292 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 DOK2O60496 412 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 GMDSO60547 372 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 RPP14O95059 124 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 TSPAN15O95858 294 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 LPLP06858 475 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 AKAIN1P0CW23 69 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 NR2C1P13056 603 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 CTLA4P16410 223 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 TBPP20226 339 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 PRSS3P35030 304 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 OR3A3P47888 321 aa4.98□□□□□ -1.61
CHRNA4-218ENST00000637243 POU3F4P49335 361 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms