RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CHODLQ9H9P2 273 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 DLL4Q9NR61 685 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ING4Q9UNL4 249 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 AKAP6Q13023 2319 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0G2JK05 382 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 IFITM5A6NNB3 132 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NOTOA8MTQ0 251 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CLDN25C9JDP6 229 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM178BH3BS89 294 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 IFNL4K9M1U5 179 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SLC17A2O00624 439 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 WNT9BO14905 357 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SLC22A1O15245 554 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RP2O75695 350 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 KDM4BO94953 1096 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF205O95201 554 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 IL1AP01583 271 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1D-12P01611 117 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PGA5P0DJD9 388 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CALCBP10092 127 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 EGR1P18146 543 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 GLRA1P23415 457 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 HTR2CP28335 458 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CD80P33681 288 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NPBWR2P48146 333 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PDLIM4P50479 330 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CLDN12P56749 244 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RIN1Q13671 783 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 P2RY14Q15391 338 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RAB11BQ15907 218 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 FAM201AQ5SY85 155 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 IDNKQ5T6J7 187 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 POC1AQ8NBT0 407 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 METTL9Q9H1A3 318 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NPTNQ9Y639 398 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ITPR2Q14571 2701 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.16□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 POLQO75417 2590 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0B4J203 849 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ISPDA4D126 451 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SRRM5B3KS81 715 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PPIAL4DF5H284 164 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 F8VVB4 439 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 F8VWA3 439 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 AIPO00170 330 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NXPH2O95156 264 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 HTR3BO95264 441 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 LHBP01229 141 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SFTPBP07988 381 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CSF3P09919 207 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CD37P11049 281 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ARSBP15848 533 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PRKACAP17612 351 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SERPINA2P20848 420 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CFHR2P36980 270 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 AVPI1Q5T686 147 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 FAM166AQ6J272 317 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 Q8IYB0 196 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.15□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PXT1Q8NFP0 134 aa7.15□□□□□ -1.26
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