RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 B4E171 279 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 F8W036 122 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 G3V3Y1 287 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPR31O00270 319 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 FBXO24O75426 580 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 SNAPINO95295 136 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLATP00750 562 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 KNG1P01042 644 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 NRASP01111 189 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 LCATP04180 440 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 P04436 131 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 ICAM2P13598 275 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 FCGR2CP31995 323 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 NTF4P34130 210 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSPAN7P41732 249 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 CAV2P51636 162 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 FUT6P51993 359 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 CARD18P57730 90 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 S100A10P60903 97 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM3AP98173 230 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 SMCO1Q147U7 214 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR8B8Q15620 311 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 TAF9Q16594 264 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 GUCA2BQ16661 112 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 Q8NFD4 153 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR2AE1Q8NHA4 323 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 SPSB4Q96A44 273 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM45BQ96B21 275 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 BORCS8Q96FH0 119 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 C18orf12Q96KH6 178 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 MICU1Q9BPX6 476 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAAP24Q9BTP7 215 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 LIME1Q9H400 295 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPR35Q9HC97 309 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 TREM1Q9NP99 234 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 PARP11Q9NR21 331 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZFP57Q9NU63 452 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 AMDHD2Q9Y303 409 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 E5RGE8 158 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 K7EPK0 472 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 XRCC2O43543 280 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANGPTL7O43827 346 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 CXCL13O43927 109 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 CYTIPO60759 359 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRP3O75074 770 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 PDCD6O75340 191 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 JTBO76095 146 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGKV1D-12P01611 117 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 CD5P06127 495 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 GLAP06280 429 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 HEXAP06865 529 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 LPAR6P43657 344 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARHGDIBP52566 201 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSG4Q00888 419 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 PDZK1IP1Q13113 114 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 HFEQ30201 348 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 NRN1LQ496H8 165 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR2A2Q6IF42 318 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 OSR2Q8N2R0 312 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR14L1PQ8NHC6 308 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 FOXB1Q99853 325 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 NRIP2Q9BQI9 281 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 RHOFQ9HBH0 211 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRLF2Q9HC73 371 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.34□□□□□ -1.07
IGHV3-54-201ENST00000622166 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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