RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHIA	Q9BZP6	476 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC1A7	O00341	560 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	HTR1A	P08908	422 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	FUT6	P51993	359 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF561	Q8N587	486 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	PKIB	Q9C010	78 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	AMBN	Q9NP70	447 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-233	ENST00000591989	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	MEIOC	A2RUB1	952 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989		J3QRE1	110 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989		M0R1W7	72 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	NPFF	O15130	113 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC16A6	O15403	523 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	IGHV4-59	P01825	116 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	OCM2	P0CE71	109 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF20	P17024	532 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ISL1	P61371	349 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	IL24	Q13007	206 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM86B	Q8N661	226 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLAMF9	Q96A28	289 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	FGGY	Q96C11	551 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	C4orf36	Q96KX1	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989		Q96MT0	163 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	CHST5	Q9GZS9	411 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989		E9PQ18	207 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989		F8VVB4	439 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989		F8VWA3	439 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANGPTL7	O43827	346 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	MPZL2	O60487	215 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	PAH	P00439	452 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBP1	P09467	338 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATF1	P18846	271 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	MPZ	P25189	248 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	IER3	P46695	156 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	POU3F4	P49335	361 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATP1B3	P54709	279 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	COL10A1	Q03692	680 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF91	Q05481	1191 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	STMN2	Q93045	179 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	CEP19	Q96LK0	163 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	ALG8	Q9BVK2	526 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989		A0A1W2PPH5	198 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	BTBD17	A6NE02	478 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	POM121C	A8CG34	1229 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPR137B	O60478	399 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	CYB5A	P00167	134 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NEDD4L-233	ENST00000591989	KNG1	P01042	644 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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