RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 CSF3P09919 207 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SPNP16150 400 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB3BP20337 219 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 GIFP27352 417 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ACVR1BP36896 505 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS5P46782 204 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 EFNA3P52797 238 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 BLVRAP53004 296 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RAG2P55895 527 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CAV3P56539 151 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2B6P58173 313 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CCL7P80098 99 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 DCDP81605 110 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 INSL4Q14641 139 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 QPRTQ15274 297 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TAB1Q15750 504 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 HACD4Q5VWC8 232 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 GUSBP11Q6P575 273 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 DNM1P34Q6PK57 102 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 APOOLQ6UXV4 268 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 LANCL3Q6ZV70 420 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 COX15Q7KZN9 410 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 GDPD3Q7L5L3 318 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SSX6Q7RTT6 188 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM122BQ7Z309 247 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD37Q7Z713 158 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 MARCH3Q86UD3 253 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 EGFL6Q8IUX8 553 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 Q8N402 240 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RFLNBQ8N5W9 214 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR51L1Q8NGJ5 315 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2T4Q8NH00 348 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6S1Q8NH40 331 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8K3Q8NH51 312 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NUBPLQ8TB37 319 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ZPLD1Q8TCW7 415 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM234Q8WY98 164 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ST8SIA1Q92185 356 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PELI1Q96FA3 418 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 Q96M85 177 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 AGAP4Q96P64 663 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPAN32Q96QS1 320 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SLITRK2Q9H156 845 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 INIPQ9NRY2 104 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 GLRX2Q9NS18 164 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf123Q9NWV4 160 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ABRACLQ9P1F3 81 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 MUTYHQ9UIF7 546 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 COPS3Q9UNS2 423 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FKBP7Q9Y680 259 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RP1P56715 2156 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 MAST4O15021 2626 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CDH23Q9H251 3354 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 IDSB3KWA1 339 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf98E9PRG8 122 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGEF9O43307 516 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 LYRM1O43325 122 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FADS1O60427 444 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNKO75909 580 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF432O94892 652 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHEP01854 428 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 UCHL1P09936 223 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ELK1P19419 428 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NPR2P20594 1047 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 C4BPBP20851 252 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SHC1P29353 583 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 GRPRP30550 384 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms