RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590205.2

CACNA1A-210, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

Gene CACNA1A, Length 3,340 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF708P17019 499 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA1A-210ENST00000590205 RFC3P40938 356 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA1A-210ENST00000590205 EMP2P54851 167 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA1A-210ENST00000590205 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CACNA1A-210ENST00000590205 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA1A-210ENST00000590205 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA1A-210ENST00000590205 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA1A-210ENST00000590205 DDA1Q9BW61 102 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA1A-210ENST00000590205 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.21□□□□□ -1.25
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CACNA1A-210ENST00000590205 CCSO14618 274 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TUBG1P23258 451 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 PTGFRP43088 359 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 PCOLCEQ15113 449 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 UBE2V2Q15819 145 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 NRN1LQ496H8 165 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 CD163Q86VB7 1156 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 UEVLDQ8IX04 471 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 COMMD1Q8N668 190 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 SPSB4Q96A44 273 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 MALSU1Q96EH3 234 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TAAR9Q96RI9 348 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 GINS3Q9BRX5 216 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 NELFAQ9H3P2 528 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 COLCA2A8K830 154 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 C9orf172C9J069 976 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 PMP2P02689 132 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 PTGER4P35408 488 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 KCNJ3P48549 501 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 RNF212Q495C1 297 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 OR8G5Q8NG78 346 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 OR10A2Q9H208 303 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 GPR84Q9NQS5 396 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 FGF21Q9NSA1 209 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.21□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TIAF1O95411 115 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 C1QTNF9P0C862 333 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 NR2C1P13056 603 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 SLC35A1P78382 337 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TAF13Q15543 124 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 FAM27BQ5VT28 67 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 SLC39A7Q92504 469 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 LIME1Q9H400 295 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 C5orf63A6NC05 138 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 OR6C6A6NF89 314 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 H7C1Q1 480 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TSPAN4O14817 238 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 SYNGR3O43761 229 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 FBXO24O75426 580 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 CST4P01036 141 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 S100A12P80511 92 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 KISS1Q15726 138 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 Q6ZPA2 131 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 ARL11Q969Q4 196 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 SEC22AQ96IW7 307 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 CYYR1Q96J86 154 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 ATMQ13315 3056 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 VAMP5O95183 116 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 PET100P0DJ07 73 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 CCL4P13236 92 aa7.19□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CACNA1A-210ENST00000590205 CHAF1BQ13112 559 aa7.19□□□□□ -1.26
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