RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589537.1

NFIC-208, Transcript of nuclear factor I C, human

TSL 2

Gene NFIC, Length 977 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIC-208	ENST00000589537	ISG15	P05161	165 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	CCR9	P51686	369 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	UBE2E1	P51965	193 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ACSM1	Q08AH1	577 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	DYRK2	Q92630	601 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	UBE2F	Q969M7	185 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	BORCS8	Q96FH0	119 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537		A0A0U1RQK1	487 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537		A6NIN4	97 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537		H0YAE9	185 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	NPFF	O15130	113 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	NDUFA7	O95182	113 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	CYB5A	P00167	134 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	KIR3DL2	P43630	455 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ERVK11-1	P61568	191 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	UBE2V2	Q15819	145 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	UTS2B	Q765I0	119 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	CALHM1	Q8IU99	346 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537		Q8IYB0	196 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	CD177	Q8N6Q3	437 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	TNFRSF14	Q92956	283 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	CEP19	Q96LK0	163 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF488	Q96MN9	340 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	MBOAT4	Q96T53	435 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	CHIA	Q9BZP6	476 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	BEX1	Q9HBH7	125 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	NEK6	Q9HC98	313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	PAH	P00439	452 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	TFF1	P04155	84 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	HTR1A	P08908	422 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	PRKACB	P22694	351 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	IER3	P46695	156 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	RBP2	P50120	134 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF91	Q05481	1191 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	SYS1	Q8N2H4	156 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	HHLA2	Q9UM44	414 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	TK1	P04183	234 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	CHRM2	P08172	466 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF20	P17024	532 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	GABRB1	P18505	474 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ATP1B3	P54709	279 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	RAG2	P55895	527 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	OR12D2	P58182	307 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	RAB40B	Q12829	278 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	GALE	Q14376	348 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ZSCAN26	Q16670	478 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	MIDN	Q504T8	468 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	STMN2	Q93045	179 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	SPSB1	Q96BD6	273 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	LGALS12	Q96DT0	336 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	MEIOC	A2RUB1	952 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537		K7N7A8	449 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	IGHV4-59	P01825	116 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	SAA4	P35542	130 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	PELI1	Q96FA3	418 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	ALG8	Q9BVK2	526 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	C8orf4	Q9NR00	106 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	C1RL	Q9NZP8	487 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NFIC-208	ENST00000589537	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23

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