RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ZAR1L	A6NP61	321 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	SYT7	O43581	403 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ATP5H	O75947	161 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	TK1	P04183	234 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	OR2T7	P0C7T2	308 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	DLX1	P56177	255 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	LY6E	Q16553	131 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM42	Q69YG0	159 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	CD177	Q8N6Q3	437 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF488	Q96MN9	340 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	AP4S1	Q9Y587	144 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	METTL15	A6NJ78	407 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	SYNGR1	O43759	233 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	SULT1C4	O75897	302 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	RBP4	P02753	201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	OCM2	P0CE71	109 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	COX7A1	P24310	79 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	MPZ	P25189	248 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	FUT6	P51993	359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	EDDM3B	P56851	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	TMED1	Q13445	227 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743		Q8IYB0	196 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	C10orf35	Q96D05	121 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	BORCS8	Q96FH0	119 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	CEP19	Q96LK0	163 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743		K7N7A8	449 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	PEX14	O75381	377 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	CCL1	P22362	96 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	HTR1F	P30939	366 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	OR12D2	P58182	307 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	PP6455	Q8WZ26	134 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	TBX5	Q99593	518 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	NEK6	Q9HC98	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	HES4	Q9HCC6	221 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743		A0A1B0GTI1	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	hADV38S2	A0JD32	116 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	PRR32	B1ATL7	298 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	CIB2	O75838	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ARG1	P05089	322 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF728	P0DKX0	622 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	PEX2	P28328	305 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ATP1B3	P54709	279 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	CDC42	P60953	191 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	EFNB1	P98172	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	COL10A1	Q03692	680 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743		Q6ZSR3	168 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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