RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ENTPD6	O75354	484 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	HAND1	O96004	215 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	OR8U8	P0C7N1	319 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	TDGF1	P13385	188 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPN2	P17655	700 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB3A	P20336	220 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	M6PR	P20645	277 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	G0S2	P27469	103 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	TDGF1P3	P51864	188 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R19	P59542	299 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	PFN3	P60673	137 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	IL5RA	Q01344	420 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	EDDM3A	Q14507	147 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0087	Q14695	138 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPK14	Q16539	360 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	PYCR3	Q53H96	274 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC32	Q5I0X7	151 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZVH6	145 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	OAF	Q86UD1	273 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	OR9G1	Q8NH87	305 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1S1	Q8NH92	325 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	NEK7	Q8TDX7	302 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5M11	Q96RB7	305 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	EMC6	Q9BV81	110 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	DDA1	Q9BW61	102 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A22	Q9H936	323 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	AIG1	Q9NVV5	245 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM206A	Q9NX38	181 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMCX1	Q9P291	453 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		2.09	□□□□□ -2.07
AKAP13-223	ENST00000560957	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	2.09	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		2.09	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	AK9	Q5TCS8	1911 aa		2.09	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0J9YXV3	536 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957		A8MXK9	166 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	UPK2	O00526	184 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SOCS3	O14543	225 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	KMO	O15229	486 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNA14	P01570	189 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV1D-16	P01601	117 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGN1	P05114	100 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CST2	P09228	141 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CD99	P14209	185 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PGAM2	P15259	253 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ATF1	P18846	271 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	BTC	P35070	178 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CEACAM6	P40199	344 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM33	P57088	247 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNJ2BP	P57105	145 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB25	P57735	213 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB5B	P61020	215 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	FMOD	Q06828	376 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PON3	Q15166	354 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS8	Q16651	343 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10G6	Q8NH81	332 aa		2.08	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		2.08	□□□□□ -2.08

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