RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 C2orf80Q0P641 193 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 PON3Q15166 354 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 GUSBP1Q15486 140 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 NPSR1Q6W5P4 371 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 SSX8Q7RTT4 187 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 NRMQ8IXM6 262 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF525Q8N782 197 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 OR7G2Q8NG99 324 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 OR6K3Q8NGY3 331 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 AKR7LQ8NHP1 331 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ACMSDQ8TDX5 336 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 DCAKDQ8WVC6 231 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 HAVCR1Q96D42 359 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 L3HYPDHQ96EM0 354 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 FMO2Q99518 471 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 SMR3AQ99954 134 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 CHIAQ9BZP6 476 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRA2Q9H9E1 313 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 POLE4Q9NR33 117 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 KLHL28Q9NXS3 571 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 MED11Q9P086 117 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ONECUT1Q9UBC0 465 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 DCDC2Q9UHG0 476 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF225Q9UK10 706 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 NPTNQ9Y639 398 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.36□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 MPDZO75970 2070 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 GJE1A6NN92 205 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 UPK1AO00322 258 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 CIB2O75838 187 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ATP5LO75964 103 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 LYPD3O95274 346 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 UTS2O95399 124 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 PSMG1O95456 288 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 PRPS2P11908 318 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 HPGDP15428 266 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF17P17021 662 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 GABRA3P34903 492 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 MEOX2P50222 304 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ARL6IP1Q15041 203 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 AANATQ16613 207 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 IMPG1Q17R60 797 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 CPTPQ5TA50 214 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 FAM71E1Q6IPT2 247 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 MOB1BQ7L9L4 216 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 DHDDSQ86SQ9 333 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 MARCH3Q86UD3 253 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 EGFL6Q8IUX8 553 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 MNS1Q8NEH6 495 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 OR1L4Q8NGR5 311 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 FNDC9Q8TBE3 224 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 IFT81Q8WYA0 676 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 HBEGFQ99075 208 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM216Q9P0N5 145 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ABCD2Q9UBJ2 740 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 KLHL21Q9UJP4 597 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 TIMM22Q9Y584 194 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.35□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 NCKAP5O14513 1909 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 MTORP42345 2549 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ITPR3Q14573 2671 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1B0GUS0 222 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1W2PQD3 144 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 SERF1AO75920 110 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 AQP8O94778 261 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 ME2P23368 584 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 LOXP28300 417 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 HTR1FP30939 366 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 CARD18P57730 90 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 DNAJB13P59910 316 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 STX5Q13190 355 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 LRRC36Q1X8D7 754 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC153Q494R4 210 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 NOXRED1Q6NXP6 359 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM107Q6UX40 140 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 TFAP2EQ6VUC0 442 aa4.34□□□□□ -1.71
TMOD3-208ENST00000560725 RNF165Q6ZSG1 346 aa4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms