RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, human

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMOD3-208	ENST00000560725	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	PON3	Q15166	354 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	OR7G2	Q8NG99	324 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	FMO2	Q99518	471 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	SMR3A	Q99954	134 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	MED11	Q9P086	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF225	Q9UK10	706 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	NPTN	Q9Y639	398 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	MPDZ	O75970	2070 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	GJE1	A6NN92	205 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	UPK1A	O00322	258 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	CIB2	O75838	187 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ATP5L	O75964	103 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	LYPD3	O95274	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	UTS2	O95399	124 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	PSMG1	O95456	288 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	PRPS2	P11908	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	HPGD	P15428	266 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF17	P17021	662 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	GABRA3	P34903	492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	MEOX2	P50222	304 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	AANAT	Q16613	207 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	IMPG1	Q17R60	797 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	MARCH3	Q86UD3	253 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	HBEGF	Q99075	208 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	NCKAP5	O14513	1909 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	MTOR	P42345	2549 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725		A0A1B0GUS0	222 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725		A0A1W2PQD3	144 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	SERF1A	O75920	110 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	AQP8	O94778	261 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	ME2	P23368	584 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	HTR1F	P30939	366 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	CARD18	P57730	90 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	DNAJB13	P59910	316 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	STX5	Q13190	355 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMOD3-208	ENST00000560725	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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