RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558285.5

USP3-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-208ENST00000558285 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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USP3-208ENST00000558285 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 SRRQ9GZT4 340 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.32□□□□□ -1.24
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USP3-208ENST00000558285 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP3-208ENST00000558285 SELENOFO60613 162 aa7.31□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 IGHV2-70P01814 119 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP3-208ENST00000558285 IGSF11Q5DX21 431 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP3-208ENST00000558285 NANPQ8TBE9 248 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP3-208ENST00000558285 ST8SIA4Q92187 359 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP3-208ENST00000558285 POFUT1Q9H488 388 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP3-208ENST00000558285 F5H5P2 479 aa7.3□□□□□ -1.24
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USP3-208ENST00000558285 SLC2A1P11166 492 aa7.3□□□□□ -1.24
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USP3-208ENST00000558285 FAM3AP98173 230 aa7.3□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.3□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MICBQ29980 383 aa7.3□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TM4SF20Q53R12 229 aa7.3□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.3□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.3□□□□□ -1.24
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