RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557500.2

TVP23BP1-201, Transcript of TVP23B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TVP23BP1, Length 617 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BP1-201ENST00000557500 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 A0A1B0GTI1 187 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 A0A1W2PPE2 198 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 A0A1W2PPH5 198 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 A0A1W2PPK0 400 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 A0A1W2PR64 198 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 A0A1W2PRV1 198 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 MEIOCA2RUB1 952 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 SRRM5B3KS81 715 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZNF879B4DU55 563 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 C22orf46C9J442 243 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 E9PI62 339 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 J3QT63 122 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 SIRPB1O00241 398 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 HSPB6O14558 160 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 CD2P06729 351 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 HSMCR30P0CW71 290 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 PSG2P11465 335 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZNF44P15621 663 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ATF1P18846 271 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 RAB3AP20336 220 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 OMGP23515 440 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 CAPGP40121 348 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 KIR3DL2P43630 455 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 RBP2P50120 134 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ETV1P50549 477 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 DLX1P56177 255 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 LGALS4P56470 323 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 PPP3R1P63098 170 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 SLC34A1Q06495 639 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 RAB40BQ12829 278 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 GALEQ14376 348 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 RSU1Q15404 277 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 UBE2V2Q15819 145 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 DGUOKQ16854 277 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 C4orf46Q504U0 113 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 PLA1AQ53H76 456 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZBTB37Q5TC79 503 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 AHSA2Q719I0 299 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 POC1AQ8NBT0 407 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 OR5D14Q8NGL3 314 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 OR14K1Q8NGZ2 314 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 NEK7Q8TDX7 302 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 PP6455Q8WZ26 134 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 AQP3Q92482 292 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 SLC25A28Q96A46 364 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 TMEM80Q96HE8 168 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 CEP19Q96LK0 163 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 WDFY2Q96P53 400 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 CHST6Q9GZX3 395 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 OR51I2Q9H344 312 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZFAND3Q9H8U3 227 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ERVK13-1Q9NX77 482 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 SCN3BQ9NY72 215 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 FRRS1LQ9P0K9 344 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 CTSZQ9UBR2 303 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 OPN4Q9UHM6 478 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ING4Q9UNL4 249 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 V9GYS6 101 aa3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.54□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.54□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.54□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 TMEM212A6NML5 194 aa3.54□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 SH2D1BO14796 132 aa3.54□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 DEGS1O15121 323 aa3.54□□□□□ -1.84
TVP23BP1-201ENST00000557500 XPNPEP2O43895 674 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms