RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 OR11A1Q9GZK7 315 aa3.56□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 RIBC2Q9H4K1 309 aa3.56□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 WDR76Q9H967 626 aa3.56□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 GIN1Q9NXP7 522 aa3.56□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 PHF11Q9UIL8 331 aa3.56□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.56□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 A0A1B0GW55 424 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 H0Y9J4 135 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 RAD51CO43502 376 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 SERF1AO75920 110 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 IGHV3-23P01764 117 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 CRYBA1P05813 215 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 PAX7P23759 505 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 RGS4P49798 205 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 GNG11P61952 73 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 C2orf54Q08AI8 447 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 PDK4Q16654 411 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 C2orf83Q53S99 150 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 STEAP4Q687X5 459 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 NIPAL3Q6P499 406 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM107Q6UX40 140 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 OR52E2Q8NGJ4 325 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 RDH5Q92781 318 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 APH1AQ96BI3 265 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 LRRC45Q96CN5 670 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 WDR34Q96EX3 536 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 ARL5BQ96KC2 179 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 MAGEB18Q96M61 343 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 TECTBQ96PL2 329 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 GAL3ST1Q99999 423 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 FANCFQ9NPI8 374 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 RDH8Q9NYR8 311 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 GHRLQ9UBU3 117 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 DUX4Q9UBX2 424 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.55□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 C5orf63A6NC05 138 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 E7ESA3 106 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 CLDN34H7C241 214 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 J3QLI3 93 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 M0R233 179 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 UBXN8O00124 270 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 ACOX3O15254 700 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 BCKDHAP12694 445 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 MLNP12872 115 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 CCL2P13500 99 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 TCP1P17987 556 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 TSPAN8P19075 237 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 HTR2AP28223 471 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 EVX1P49640 407 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 AP1S2P56377 157 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 GNB2P62879 340 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 TGM3Q08188 693 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 PRR4Q16378 134 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 LINC01620Q4KN68 170 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 CPTPQ5TA50 214 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 SAXO2Q658L1 398 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC48A1Q6P1K1 146 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 MED27Q6P2C8 311 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 FRA10AC1Q70Z53 315 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 MDP1Q86V88 176 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 PNKDQ8N490 385 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 SPATA4Q8NEY3 305 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 CDC26Q8NHZ8 85 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 PEX13Q92968 403 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF681Q96N22 645 aa3.54□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms