RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TDGF1P3P51864 188 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ST3GAL2Q16842 350 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FBXW5Q969U6 566 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 SLC6A7Q99884 636 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 OR51J1Q9H342 316 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZNF69Q9UC07 566 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 DUSP13Q9UII6 198 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ABCA4P78363 2273 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 CACNA1BQ00975 2339 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 SULT1C2O00338 296 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 IGKV3-15P01624 115 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 CXCL3P19876 107 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 BCL3P20749 454 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 TIMP3P35625 211 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MPV17P39210 176 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 TSPAN5P62079 268 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PSG7Q13046 419 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 OSR2Q8N2R0 312 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 OR4K15Q8NH41 348 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MUCL1Q96DR8 90 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MICU1Q9BPX6 476 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PECRQ9BY49 303 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MSL2Q9HCI7 577 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ITPR1Q14643 2758 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 A0A0G2JNJ9 132 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MFNGO00587 321 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ICMTO60725 284 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 RHBDL1O75783 438 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 TPPPO94811 219 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 NDUFB6O95139 128 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 GRPP07492 148 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ALDH3B1P43353 468 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 UCNP55089 124 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 BTG1P62324 171 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZFP69Q49AA0 526 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 C4orf46Q504U0 113 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 CDH24Q86UP0 819 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 SNAPC3Q92966 411 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 Q96M66 194 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 GHITMQ9H3K2 345 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 Q9UFV3 132 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 H0YL77 283 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MELTFP08582 738 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 AMY2BP19961 511 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 LY6DQ14210 128 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 FAM189A2Q15884 450 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 NEK7Q8TDX7 302 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 CHIAQ9BZP6 476 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.21□□□□□ -1.25
CS-215ENST00000549143 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 CDIPTO14735 213 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 CST4P01036 141 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 PI3P19957 117 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 CALCRP30988 508 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR3A3P47888 321 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 MICBQ29980 383 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 A8MXE2 369 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 HS3ST1O14792 307 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 AKR7A2O43488 359 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 PRKACAP17612 351 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms