RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 CEP78Q5JTW2 689 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 RNF144BQ7Z419 303 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 DHFR2Q86XF0 187 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ZNF573Q86YE8 665 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 CALHM1Q8IU99 346 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 LYG1Q8N1E2 194 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ZNF561Q8N587 486 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 GIPC3Q8TF64 312 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 C17orf50Q8WW18 174 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 AQP3Q92482 292 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 AMELYQ99218 206 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 MROQ9BYG7 248 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 OR51I2Q9H344 312 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 C8orf4Q9NR00 106 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.86□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 A0A0U1RQV5 110 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 H0YJX3 145 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 PRODHO43272 600 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 SELENOFO60613 162 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 NRASP01111 189 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 CD28P10747 220 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 LYL1P12980 280 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 LMO1P25800 156 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 DCTDP32321 178 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 MAGEA2P43356 314 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 OR12D2P58182 307 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ESRRGP62508 458 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 GINS1Q14691 196 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 HCP5Q6MZN7 132 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.85□□□□□ -1.31
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TROAP-208ENST00000548817 CPOQ8IVL8 374 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 Q8NFD4 153 aa6.85□□□□□ -1.31
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TROAP-208ENST00000548817 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 MALSU1Q96EH3 234 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 LYZL4Q96KX0 146 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 TSC22D3Q99576 134 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 FEVQ99581 238 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 MUC13Q9H3R2 512 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 PALMDQ9NP74 551 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ZNF222Q9UK12 451 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 POMPQ9Y244 141 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 J3QT63 122 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 F2RL2O00254 374 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 CHST1O43916 411 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ZNF254O75437 659 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 E2F6O75461 281 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 CST1P01037 141 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ARG1P05089 322 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 PF4V1P10720 104 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ATP6V1B2P21281 511 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 PAX6P26367 422 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 HAAOP46952 286 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 FLOT2Q14254 428 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 SSX2Q16385 188 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 CD177Q8N6Q3 437 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 POC1AQ8NBT0 407 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.84□□□□□ -1.31
TROAP-208ENST00000548817 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.84□□□□□ -1.31
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