RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 OSGIN2Q9Y236 505 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 PRR33A8MZF0 331 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 BPNT1O95861 308 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 CXCL1P09341 107 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 AMY2BP19961 511 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 SPINK2P20155 84 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 HOXA5P20719 270 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 HEPN1Q6WQI6 88 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 LHFPL1Q86WI0 220 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8□□□□□ -1.13
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THBS3-211ENST00000541990 OR5H2Q8NGV7 314 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 WWTR1Q9GZV5 400 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 TUBA4BQ9H853 241 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 FAM206AQ9NX38 181 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 MED29Q9NX70 200 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 EHFQ9NZC4 300 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 CHD8Q9HCK8 2581 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 NCOR2Q9Y618 2525 aa8□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 SYT7O43581 403 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 GUSBP08236 651 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 CEBPGP53567 150 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 RNF4P78317 190 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 CCL20P78556 96 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 GAMTQ14353 236 aa7.99□□□□□ -1.13
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THBS3-211ENST00000541990 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 KMT5CQ86Y97 462 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.99□□□□□ -1.13
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THBS3-211ENST00000541990 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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THBS3-211ENST00000541990 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 IL17BQ9UHF5 180 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 VDAC3Q9Y277 283 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 CDC14BO60729 498 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 OR2C1O95371 312 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 DIRAS3O95661 229 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 ISG15P05161 165 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 ACP1P24666 158 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 HSD11B1P28845 292 aa7.99□□□□□ -1.13
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THBS3-211ENST00000541990 GLO1Q04760 184 aa7.99□□□□□ -1.13
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THBS3-211ENST00000541990 REEP6Q96HR9 211 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 PRRX2Q99811 253 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 NBASA2RRP1 2371 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 C5orf63A6NC05 138 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 MSTNO14793 375 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 DEDDO75618 318 aa7.99□□□□□ -1.13
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THBS3-211ENST00000541990 H2BFMP0C1H6 154 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 SERPINA2P20848 420 aa7.99□□□□□ -1.13
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THBS3-211ENST00000541990 ZNF84P51523 738 aa7.99□□□□□ -1.13
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THBS3-211ENST00000541990 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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THBS3-211ENST00000541990 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 OR5AS1Q8N127 324 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 NTNG2Q96CW9 530 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 MVB12AQ96EY5 273 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 EMC6Q9BV81 110 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.99□□□□□ -1.13
THBS3-211ENST00000541990 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.99□□□□□ -1.13
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