RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 CNBD2Q96M20 576 aa15.79■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 CDCA4Q9BXL8 241 aa15.79■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 RASSF4Q9H2L5 321 aa15.79■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 HES4Q9HCC6 221 aa15.79■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 OPN4Q9UHM6 478 aa15.79■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF222Q9UK12 451 aa15.79■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.79■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ENSAO43768 121 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ALX3O95076 343 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PLATP00750 562 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 CD2P06729 351 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 OCM2P0CE71 109 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PSG2P11465 335 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 SOX2P48431 317 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 MTCP1P56278 107 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ERVK11-1P61568 191 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PAX8Q06710 450 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 CD276Q5ZPR3 534 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 OR5D14Q8NGL3 314 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 SGCDQ92629 289 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PGLYRP3Q96LB9 341 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 GAFA1Q96PS6 74 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 MRI1Q9BV20 369 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 MND1Q9BWT6 205 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 DUSP21Q9H596 190 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 NEK6Q9HC98 313 aa15.78■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 SIGLEC5O15389 551 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 NDUFB3O43676 98 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 SULT1B1O43704 296 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 NXPH2O95156 264 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 IFNA2P01563 188 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 TFF1P04155 84 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 SELLP14151 372 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ADRA2CP18825 462 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 POU3F4P49335 361 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 IL13RA1P78552 427 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 DOC2BQ14184 412 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC25A26Q70HW3 274 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 BATF2Q8N1L9 274 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 FGFRL1Q8N441 504 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ST8SIA4Q92187 359 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 GHSRQ92847 366 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 MED30Q96HR3 178 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP19Q96LK0 163 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 AUP1Q9Y679 476 aa15.77■□□□□ 0.12
PACSIN3-208ENST00000531226 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 ECDO95905 644 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 CRHBPP24387 322 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 GABRA2P47869 451 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 BDH1Q02338 343 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 IKZF1Q13422 519 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 IRF3Q14653 427 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC10Q5BKY1 277 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 ASPHD2Q6ICH7 369 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF529Q6P280 563 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 MKXQ8IYA7 352 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 OR13C5Q8NGS8 318 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 NANPQ8TBE9 248 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM106AQ96A25 262 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 SLAMF9Q96A28 289 aa15.76■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 RFPL4AA6NLU0 287 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR37O15354 613 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 FSHBP01225 129 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 CD1AP06126 327 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 HCKP08631 526 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 RAB3AP20336 220 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 ACSM1Q08AH1 577 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 DGUOKQ16854 277 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 CRIP3Q6Q6R5 217 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 BTN2A1Q7KYR7 527 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 Q8IYB0 196 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 RFT1Q96AA3 541 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 SDSLQ96GA7 329 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 SPACA5Q96QH8 159 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 TAS2R4Q9NYW5 299 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 METRNQ9UJH8 293 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 MAB21L2Q9Y586 359 aa15.75■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 SVEP1Q4LDE5 3571 aa15.74■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 F8VVB4 439 aa15.74■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 F8VWA3 439 aa15.74■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 RGS10O43665 173 aa15.74■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 CYB5AP00167 134 aa15.74■□□□□ 0.11
PACSIN3-208ENST00000531226 KNG1P01042 644 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms