RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 C18orf12Q96KH6 178 aa6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ADOQ96SZ5 270 aa6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 RARRES2Q99969 163 aa6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PRO1933Q9H354 126 aa6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 HSF4Q9ULV5 492 aa6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.62□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF727A8MUV8 499 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PHOX2AO14813 284 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 IFNA1P01562 189 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ATP6V0CP27449 155 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 FHITP49789 147 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 HSF1Q00613 529 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 RUNX3Q13761 415 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ERV3-1Q14264 604 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ICAM4Q14773 271 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 IQCJQ1A5X6 159 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM18Q96B42 140 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 DDIT4LQ96D03 193 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 DDA1Q9BW61 102 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CHST11Q9NPF2 352 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 STARD5Q9NSY2 213 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 VAX2Q9UIW0 290 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.61□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 MS4A18H0YCH9 400 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 H0YL77 283 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 M0R143 59 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TSPAN2O60636 221 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 C1QL1O75973 258 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TNFP01375 233 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PGA3P0DJD8 388 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 FOSL2P15408 326 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF43P17038 809 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 GJA4P35212 333 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CTNNB1P35222 781 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TNFRSF4P43489 277 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 GABREP78334 506 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TLE3Q04726 772 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OR8B8Q15620 311 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 KISS1Q15726 138 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 HAGHQ16775 308 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OTPQ5XKR4 325 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 OR1P1Q8NH06 330 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 GPR119Q8TDV5 335 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 HAS2Q92819 552 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TSLPQ969D9 159 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 RRAGCQ9HB90 399 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CDH20Q9HBT6 801 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 CRLF2Q9HC73 371 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 WASF3Q9UPY6 502 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 VDAC3Q9Y277 283 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.6□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.59□□□□□ -1.35
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1B0GU03 582 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms