RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 HLA-HP01893 362 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GSTA1P08263 222 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RPS17P08708 135 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 BCKDHAP12694 445 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CBR1P16152 277 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TAC1P20366 129 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CXCR1P25024 350 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 LCN1P31025 176 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ARR3P36575 388 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 IDH2P48735 452 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PITPNBP48739 271 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SERPINB8P50452 374 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CNN1P51911 297 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RPS23P62266 143 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GNB2P62879 340 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF154Q13106 437 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 DEFB112Q30KQ8 113 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CNPY1Q3B7I2 92 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GGTA1PQ4G0N0 100 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GPAT3Q53EU6 434 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CARD17Q5XLA6 110 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ETFRF1Q6IPR1 90 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ATRAIDQ6UW56 229 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 BRD3OSQ6XYD6 125 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KDM8Q8N371 416 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CADM2Q8N3J6 435 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CCNYL1Q8N7R7 359 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OR5D16Q8NGK9 328 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OR5AK3PQ8NH89 298 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 FNDC8Q8TC99 324 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ST8SIA1Q92185 356 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CCL17Q92583 94 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SLC25A36Q96CQ1 311 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 DDIT4LQ96D03 193 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TSSK3Q96PN8 268 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OR7D2Q96RA2 312 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TAPBPLQ9BX59 468 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RACGAP1Q9H0H5 632 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PIGUQ9H490 435 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 NOX3Q9HBY0 568 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MMP26Q9NRE1 261 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CENPMQ9NSP4 180 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CHRNA9Q9UGM1 479 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 POFUT2Q9Y2G5 429 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CACNG2Q9Y698 323 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TRAV40A0A0B4J280 105 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 E7ESA3 106 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TRAPPC2LH3BP13 241 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PANO1I0J062 215 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 M0R3G1 203 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SLC17A2O00624 439 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PEX11AO75192 247 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RP2O75695 350 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RAB36O95755 333 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KRT16P08779 473 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OR8G3PP0DMU2 310 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CCL2P13500 99 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CCNOP22674 350 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PAX7P23759 505 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB25P24278 435 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GLRXP35754 106 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MAP3K8P41279 467 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CRYBB2P43320 205 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MAGEA4P43358 317 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ASMTP46597 345 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ALDH3B2P48448 385 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CCT3P49368 545 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PLTPP55058 493 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RPL38P63173 70 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 BNIP2Q12982 314 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SKP2Q13309 424 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 C1DQ13901 141 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA0040Q15053 153 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CEACAM16Q2WEN9 425 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TTMPQ5BVD1 217 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF678Q5SXM1 525 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 C16orf62Q7Z3J2 963 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GRINAQ7Z429 371 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CLEC4FQ8N1N0 589 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa2.54□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZIC4Q8N9L1 334 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms