RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa13.72□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 CALHM1Q8IU99 346 aa13.72□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 SLC35F2Q8IXU6 374 aa13.72□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 KLHDC1Q8N7A1 406 aa13.72□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 OR14K1Q8NGZ2 314 aa13.72□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.72□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 MOB1AQ9H8S9 216 aa13.72□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 ADGRL4Q9HBW9 690 aa13.72□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 HES4Q9HCC6 221 aa13.72□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 POMPQ9Y244 141 aa13.72□□□□□ -0.21
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HERC3-211ENST00000513325 PIPP12273 146 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
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HERC3-211ENST00000513325 ACTR3P61158 418 aa13.71□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 ANGPTL5Q86XS5 388 aa13.71□□□□□ -0.21
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HERC3-211ENST00000513325 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
HERC3-211ENST00000513325 SNX5Q9Y5X3 404 aa13.71□□□□□ -0.21
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HERC3-211ENST00000513325 OPN1MWP04001 364 aa13.7□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 OPN1MW2P0DN77 364 aa13.7□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 OPN1MW3P0DN78 364 aa13.7□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 VSIG10L2P0DP72 767 aa13.7□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 EPHA2P29317 976 aa13.7□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 ERVK11-1P61568 191 aa13.7□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 PLA1AQ53H76 456 aa13.7□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 AADACL4Q5VUY2 407 aa13.7□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 NXNL2Q5VZ03 156 aa13.7□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 LIAT1Q6ZQX7 453 aa13.7□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 IL4I1Q96RQ9 567 aa13.7□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 MNTQ99583 582 aa13.7□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP13.7□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A13Q9Y226 551 aa13.7□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa13.69□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa13.69□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 DHRS7CA6NNS2 312 aa13.69□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 H3BSH0 61 aa13.69□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 K7N7A8 449 aa13.69□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 COL10A1Q03692 680 aa13.69□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 PKIBQ9C010 78 aa13.69□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 KRT84Q9NSB2 600 aa13.69□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 VGLL3A8MV65 326 aa13.68□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 F8VWA3 439 aa13.68□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 CCL1P22362 96 aa13.68□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 IL24Q13007 206 aa13.68□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 BEAN1Q3B7T3 259 aa13.68□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 C12orf73Q69YU5 71 aa13.68□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 SSX6Q7RTT6 188 aa13.68□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 LYG1Q8N1E2 194 aa13.68□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 YIPF7Q8N8F6 280 aa13.68□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 DTX3Q8N9I9 347 aa13.68□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 TBX5Q99593 518 aa13.68□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 ZNF702PQ9H963 129 aa13.68□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 ZAR1LA6NP61 321 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 ZNF737O75373 536 aa13.67□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF728P0DKX0 622 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 EDDM3BP56851 147 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 UBE2V2Q15819 145 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 FAM189A2Q15884 450 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 SSX2Q16385 188 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 SAMD5Q5TGI4 173 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHA1Q9HB21 404 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 MTCH1Q9NZJ7 389 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 TCF19Q9Y242 345 aa13.67□□□□□ -0.22
HERC3-211ENST00000513325 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
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