RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511338.1

SEC31A-232, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SEC31A, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-232ENST00000511338 GLI3P10071 1580 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 GTF2H1P32780 548 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 UBE2AP49459 152 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 ZNF136P52737 540 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 BLVRAP53004 296 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 CRISP3P54108 245 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TAS2R31P59538 309 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 ARG2P78540 354 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 CYP24A1Q07973 514 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 ERCC8Q13216 396 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 DMC1Q14565 340 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 AVPI1Q5T686 147 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 HHATQ5VTY9 493 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TPGS1Q6ZTW0 290 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 GAPTQ8N292 157 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 OR2L5Q8NG80 312 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 PIFOQ8TCI5 191 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 WDR34Q96EX3 536 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TAAR1Q96RJ0 339 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 RSG1Q9BU20 258 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TMEM243Q9BU79 118 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 ZNF426Q9BUY5 554 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 EMC6Q9BV81 110 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TMED9Q9BVK6 235 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 RDH14Q9HBH5 336 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 ABCB9Q9NP78 766 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 HEBP1Q9NRV9 189 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 NAGKQ9UJ70 344 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 FBXL3Q9UKT7 428 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 ORC6Q9Y5N6 252 aa3.06□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 QRICH2Q9H0J4 1663 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 USP32Q8NFA0 1604 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 ADGRB1O14514 1584 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 ERVK-7P63135 1459 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 DISP2A7MBM2 1401 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 KIAA0232Q92628 1395 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TCAPO15273 167 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 FABP7O15540 132 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 RAB36O95755 333 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TRBV12-3P01733 135 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 LIMS3P0CW19 117 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 LIMS4P0CW20 117 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 APLNRP35414 380 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 PPOXP50336 477 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 IFITM3Q01628 133 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 IRF4Q15306 451 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TTC32Q5I0X7 151 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 MFSD14CQ5VZR4 134 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 LFNGQ8NES3 379 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 LINC01006Q8NI28 216 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 DNAJB3Q8WWF6 145 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TMEM158Q8WZ71 300 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 CDS1Q92903 461 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TMEM159Q96B96 161 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TM4SF18Q96CE8 201 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 SLC35E1Q96K37 410 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 SPZ1Q9BXG8 430 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 NANOGQ9H9S0 305 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 CASZ1Q86V15 1759 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 KNDC1Q76NI1 1749 aa3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 C9J4A7 227 aa3.04□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 GOLGA8KD6RF30 607 aa3.04□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.04□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 PSPHP1O15172 72 aa3.04□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 MPZL2O60487 215 aa3.04□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 CA11O75493 328 aa3.04□□□□□ -1.92
SEC31A-232ENST00000511338 IGKV1D-16P01601 117 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms