RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502394.1

MATR3-231, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 589 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-231	ENST00000502394	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394		Q96M66	194 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	DIRC2	Q96SL1	478 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	IL19	Q9UHD0	177 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MATR3-231	ENST00000502394	LRRK2	Q5S007	2527 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394		A0A0A6YYH2	397 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394		A6NJ64	397 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	FAM25A	B3EWG3	89 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	FAM25C	B3EWG5	89 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	FAM25G	B3EWG6	89 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394		F8VVB4	439 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394		F8VWA3	439 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	RAB27B	O00194	218 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	SPRY3	O43610	288 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	RHBDL1	O75783	438 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	TPPP	O94811	219 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	MPIG6B	O95866	241 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	PLAT	P00750	562 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	CD8A	P01732	235 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	PGA5	P0DJD9	388 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	MGMT	P16455	207 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	BCL3	P20749	454 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77	2e-8	■■■□□ 16
MATR3-231	ENST00000502394	PMEL	P40967	661 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	NPBWR2	P48146	333 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	GPR176	Q14439	515 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	MPPED2	Q15777	294 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	FAM209A	Q5JX71	171 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	WDR82	Q6UXN9	313 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	MUC15	Q8N387	334 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	SLAMF9	Q96A28	289 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	CEP19	Q96LK0	163 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	CST11	Q9H112	138 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	BANF2	Q9H503	90 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	RHOF	Q9HBH0	211 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	HES4	Q9HCC6	221 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	HMG20A	Q9NP66	347 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	COL12A1	Q99715	3063 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	CDIPT	O14735	213 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	AKR7A2	O43488	359 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	GRP	P07492	148 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	SERPINA2	P20848	420 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	CDK2	P24941	298 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	NR4A2	P43354	598 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	PTH2R	P49190	550 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	PPOX	P50336	477 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	FGF12	P61328	243 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF846	Q147U1	533 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	RSU1	Q15404	277 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	POC1A	Q8NBT0	407 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394		Q8TCH9	128 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	FAM46B	Q96A09	425 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	NICN1	Q9BSH3	213 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	SRR	Q9GZT4	340 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	FABP12	A6NFH5	140 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	XRCC3	O43542	346 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	HTR3B	O95264	441 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	HLA-DQB1	P01920	261 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	SOD3	P08294	240 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	GTF2F2	P13984	249 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	CD40LG	P29965	261 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	PPP5C	P53041	499 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM50B	P56557	158 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	TAS2R20	P59543	309 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	TLE4	Q04727	773 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	TESK1	Q15569	626 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MATR3-231	ENST00000502394	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		10.25	□□□□□ -0.77

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