RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	VWF	P04275	2813 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	TIMM23	O14925	209 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ACSM1	Q08AH1	577 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF273	Q14593	569 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ITFG2	Q969R8	447 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	METTL15	A6NJ78	407 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618		F8VVB4	439 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618		F8VWA3	439 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	SYT7	O43581	403 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	TSPAN15	O95858	294 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	TK1	P04183	234 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	HTR1F	P30939	366 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	TGFBR2	P37173	567 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	COL10A1	Q03692	680 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	UBE2V2	Q15819	145 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618		Q6ZSR3	168 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5R1	Q8NH85	324 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	UBE2F	Q969M7	185 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	SLAMF9	Q96A28	289 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	HES4	Q9HCC6	221 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	TSPAN9	O75954	239 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2T7	P0C7T2	308 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	FCGR1A	P12314	374 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	CCL1	P22362	96 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	MPZ	P25189	248 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ATP6V1E1	P36543	226 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	RASSF2	P50749	326 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	TP53I3	Q53FA7	332 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	RDH10	Q8IZV5	341 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	EME1	Q96AY2	570 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ADI1	Q9BV57	179 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	PKIB	Q9C010	78 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	MMP27	Q9H306	513 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	USE1	Q9NZ43	259 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	GNG8	Q9UK08	70 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A1W2PPH5	198 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	KIR3DL2	P43630	455 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ERVK11-1	P61568	191 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF85	Q03923	595 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	IL24	Q13007	206 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ATG4B-223	ENST00000493618	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	CIB2	O75838	187 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	ATP5H	O75947	161 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	CALCB	P10092	127 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	GABRA5	P31644	462 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	LGALS4	P56470	323 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	EDDM3B	P56851	147 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	CEP19	Q96LK0	163 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618		K7N7A8	449 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	CHST1	O43916	411 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	SULT1C4	O75897	302 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	ARG1	P05089	322 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	CHRM2	P08172	466 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB13	P51153	203 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATG4B-223	ENST00000493618	FUT6	P51993	359 aa		11.88	□□□□□ -0.51

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