RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF879	B4DU55	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717		M0R135	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	LYZL6	O75951	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	HLA-H	P01893	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF20	P17024	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ADRA2C	P18825	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	HOXA5	P20719	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ARR3	P36575	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ETV6	P41212	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	WNT5A	P41221	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	MAGEB1	P43366	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	CX3CR1	P49238	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	OR8B8	Q15620	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717		Q499Y3	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM42	Q69YG0	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	NAA40	Q86UY6	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	MDP1	Q86V88	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC7A6	Q92536	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ROS1	P08922	2347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	MAST4	O15021	2626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	DSCAM	O60469	2012 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	HSPB6	O14558	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SERPINA3	P01011	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	APOC1	P02654	83 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SERPINA5	P05154	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	VPREB1	P12018	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF35	P13682	527 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	CBR1	P16152	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PAX7	P23759	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ACKR3	P25106	362 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SDC2	P34741	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	DDOST	P39656	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ASCL1	P50553	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SCN1B	Q07699	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	THRSP	Q92748	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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