RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 OR4K2Q8NGD2 314 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 OR10G6Q8NH81 332 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 OR2AE1Q8NHA4 323 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 CEP19Q96LK0 163 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 METTL26Q96S19 204 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 EMC6Q9BV81 110 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 RHOFQ9HBH0 211 aa3.37□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 COMMD9Q9P000 198 aa3.37□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 SLC31A1O15431 190 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 ZNF861PO60384 105 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 SLC25A27O95847 323 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 MOSP00540 346 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 RLN2P04090 185 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PSKH1P11801 424 aa3.36□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 STC1P52823 247 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 CYP24A1Q07973 514 aa3.36□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 SLC36A2Q495M3 483 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 COX19Q49B96 90 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.36□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.36□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.36□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 NPBQ8NG41 125 aa3.36□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 TMEM56Q96MV1 263 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 RILPQ96NA2 401 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 TIMM17AQ99595 171 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PITX2Q99697 317 aa3.36□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.35□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 CTSLP07711 333 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 COX5BP10606 129 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 IDO1P14902 403 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 CRISP2P16562 243 aa3.35□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 ACTR1BP42025 376 aa3.35□□□□□ -1.87
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CCL20-204ENST00000489160 DLX6P56179 175 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 OR10A3P58181 314 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 ERCC8Q13216 396 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 MOGQ16653 247 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 TMEM31Q5JXX7 168 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 MED27Q6P2C8 311 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 Q6ZSR6 202 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 RNF175Q8N4F7 328 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 CCNYL1Q8N7R7 359 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 ACTL9Q8TC94 416 aa3.35□□□□□ -1.87
CCL20-204ENST00000489160 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa3.35□□□□□ -1.87
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