RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 UCK1Q9HA47 277 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 MED12Q93074 2177 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 A0A0A6YYD4 124 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 PTGER4P35408 488 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ARL4DP49703 201 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ZNF429Q86V71 674 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 SNX22Q96L94 193 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 MASP2O00187 686 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ADAM10O14672 748 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 MDKP21741 143 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 IL2RGP31785 369 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 OR3A4PP47883 348 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 TMEM50BP56557 158 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 QRFPP83859 136 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 REEP6Q96HR9 211 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 SOX7Q9BT81 388 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 COL6A3P12111 3177 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 RBFOX3A6NFN3 312 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 A8MVM7 634 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 LMO7DNF2Z398 122 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 SLC2A1P11166 492 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 HSD11B2P80365 405 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 OR51T1Q8NGJ9 327 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 FRZBQ92765 325 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 TOMM40LQ969M1 308 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 FAM86C1Q9NVL1 165 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ZNF205O95201 554 aa11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 JMJD7P0C870 316 aa11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 FBLP22087 321 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 NPRL2Q8WTW4 380 aa11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 C2orf88Q9BSF0 95 aa11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 MMACHCQ9Y4U1 282 aa11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.83□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 SHISA8B8ZZ34 492 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 ALG1L2C9J202 215 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 E5RGE8 158 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 OMGP23515 440 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 P2RY1P47900 373 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 KCNG3Q8TAE7 436 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 NSG2Q9Y328 171 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 GP1BBP13224 206 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 LYPD6Q86Y78 171 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 ZNF519Q8TB69 540 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 YPEL4Q96NS1 127 aa11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 CDC14BO60729 498 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 ISG15P05161 165 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 MAS1LP35410 378 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 RNF4P78317 190 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 PCK2Q16822 640 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 LFNGQ8NES3 379 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 FAM210BQ96KR6 192 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 TXNIPQ9H3M7 391 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 ZNF724A8MTY0 619 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 SOX15O60248 233 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 PGA4P0DJD7 388 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 PGA5P0DJD9 388 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 SLC6A8P48029 635 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 NXPH1P58417 271 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 TAS2R46P59540 309 aa11.82□□□□□ -0.52
NISCH-212ENST00000488380 RND3P61587 244 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms