RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 H7C2Y5 167 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ALDH3B1P43353 468 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 FAM27E3Q08E93 113 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ASAH1Q13510 395 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 GALMQ96C23 342 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 NBASA2RRP1 2371 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 C3orf80F5H4A9 247 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ZNHIT1O43257 154 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 ST8SIA4Q92187 359 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 MED30Q96HR3 178 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRD-211ENST00000486161 LGI3Q8N145 548 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-211ENST00000486161 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.18□□□□□ -1.26
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