RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TBX5Q99593 518 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PRRX2Q99811 253 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 AGMATQ9BSE5 352 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RAB22AQ9UL26 194 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 MED31Q9Y3C7 131 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 XKRY2A2RUG3 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 MSGN1A6NI15 193 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 AQP7P3A6NL99 342 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 XKRYO14609 159 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 AGPAT2O15120 278 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 LINC01565O15544 149 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SEMA4FO95754 770 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 LCATP04180 440 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 DBHP09172 617 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PGA4P0DJD7 388 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PGA5P0DJD9 388 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CEACAM1P13688 526 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 IL9P15248 144 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 NTSP30990 170 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 MPLP40238 635 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TMEM33P57088 247 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 FXYD6P3P58550 94 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 FOXF1Q12946 379 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ENPP2Q13822 863 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ARL6IP1Q15041 203 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 NRN1LQ496H8 165 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RTL6Q6ICC9 239 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RPTNQ6XPR3 784 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 MTURNQ8N3F0 131 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 AMER3Q8N944 861 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 OR2L2Q8NH16 312 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZNF563Q8TA94 476 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TMEM239Q8WW34 195 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PELI2Q9HAT8 420 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 Q9N2K0 584 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 FBXL17Q9UF56 701 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RNF150Q9ULK6 438 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 COX11Q9Y6N1 276 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 OR6C6A6NF89 314 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 GJE1A6NN92 205 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CDC42EP2O14613 210 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CCL25O15444 150 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RAMP1O60894 148 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RAMP3O60896 148 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CTSVO60911 334 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CA11O75493 328 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 UPK3AO75631 287 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 REG1AP05451 166 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 KLK1P06870 262 aa6.29□□□□□ -1.4
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