RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, human

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SZRD1-208	ENST00000476423	CNIH2	Q6PI25	160 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	C11orf88	Q6PI97	169 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	NFKBID	Q8NI38	313 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CMTM3	Q96MX0	182 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR4F4	Q96R69	305 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IFT27	Q9BW83	186 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GPR160	Q9UJ42	338 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	HERC2	O95714	4834 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ZAR1L	A6NP61	321 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	C5orf58	C9J3I9	102 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	C11orf98	E9PRG8	122 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423		L7N2F9	121 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423		M0R3H8	397 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	UBE2C	O00762	179 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	PLPP3	O14495	311 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ATG12	O94817	140 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR2A4	O95047	310 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	LYPD3	O95274	346 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IFNA10	P01566	189 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IGHV1-46	P01743	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	THY1	P04216	161 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TCRB	P04435	133 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	HLA-DPB1	P04440	258 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SLC2A1	P11166	492 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GPX2	P18283	190 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CD33	P20138	364 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	RAB3B	P20337	219 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	AHCY	P23526	432 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	AQP1	P29972	269 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	S100A11	P31949	105 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	MNDA	P41218	407 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	WNT5A	P41221	380 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CSNK1A1	P48729	337 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	AP3S2	P59780	193 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ACSM1	Q08AH1	577 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	RBBP4	Q09028	425 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IL18	Q14116	193 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GPR176	Q14439	515 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	MPPED2	Q15777	294 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	VMAC	Q2NL98	169 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	C4orf46	Q504U0	113 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	RNF144B	Q7Z419	303 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR6V1	Q8N148	313 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	FTMT	Q8N4E7	242 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	BBS10	Q8TAM1	723 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TMEM54	Q969K7	222 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR2A7	Q96R45	310 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	MMP26	Q9NRE1	261 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	VNN3	Q9NY84	501 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CALML5	Q9NZT1	146 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TMEM218	A2RU14	115 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TNFRSF11B	O00300	401 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CTDSPL	O15194	276 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GPR137B	O60478	399 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	UBL3	O95164	117 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SERPINA3	P01011	423 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IGHM	P01871	453 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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