RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-210	ENST00000469034	RAB5B	P61020	215 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	DCAF7	P61962	342 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM3A	P98173	230 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	GLO1	Q04760	184 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	FMOD	Q06828	376 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	FZD2	Q14332	565 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034		Q7L0L9	218 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	GRINA	Q7Z429	371 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TSLP	Q969D9	159 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CUTC	Q9NTM9	273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SPTB	P11277	2137 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034		A0A1B0GW64	132 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034		A0A1W2PP11	408 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SGCE	O43556	437 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SYT7	O43581	403 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	EFNA2	O43921	213 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CA11	O75493	328 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CLN5	O75503	358 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	MED6	O75586	246 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	AHSA1	O95433	338 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	OR8U9	P0C7N5	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	PRF1	P14222	555 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CBR1	P16152	277 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF17	P17021	662 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CCL1	P22362	96 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	GLRA1	P23415	457 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ACKR3	P25106	362 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	AKT2	P31751	481 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	CD80	P33681	288 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SNCA	P37840	140 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	AKR1C3	P42330	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	OR3A4P	P47883	348 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	C1orf61	Q13536	156 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	HMGN3	Q15651	99 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	OPN5	Q6U736	354 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034		Q6ZRG5	221 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	COX15	Q7KZN9	410 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SUMO1-210	ENST00000469034	NRAC	Q8N912	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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