RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467246.5

HPS1-208, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HPS1, Length 2,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-208ENST00000467246 ZNF546Q86UE3 836 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-208ENST00000467246 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-208ENST00000467246 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-208ENST00000467246 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-208ENST00000467246 RGCCQ9H4X1 137 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-208ENST00000467246 PRR13Q9NZ81 148 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-208ENST00000467246 EHFQ9NZC4 300 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-208ENST00000467246 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.9□□□□□ -0.82
HPS1-208ENST00000467246 RP2O75695 350 aa9.9□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 SNAPC5O75971 98 aa9.9□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 RPA2P15927 270 aa9.9□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 HLA-GP17693 338 aa9.9□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 ATP1B3P54709 279 aa9.9□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 BRICD5Q6PL45 260 aa9.9□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 LHFPL1Q86WI0 220 aa9.9□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 APH1AQ96BI3 265 aa9.9□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 AKR1C2P52895 323 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 AKR1C1Q04828 323 aa9.89□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 PLCXD3Q63HM9 321 aa9.89□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 ZNF100Q8IYN0 542 aa9.89□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.89□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.89□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 SLC9A3R2Q15599 337 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.89□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 SPSB4Q96A44 273 aa9.89□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 FAM117AQ9C073 453 aa9.89□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 XRCC2O43543 280 aa9.88□□□□□ -0.83
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HPS1-208ENST00000467246 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 COMMD9Q9P000 198 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 AK3Q9UIJ7 227 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-208ENST00000467246 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.88□□□□□ -0.83
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