RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACTG1P63261 375 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DGUOKQ16854 277 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CALHM1Q8IU99 346 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FGFRL1Q8N441 504 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR5AK2Q8NH90 309 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NRIP2Q9BQI9 281 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCTN5Q9BTE1 182 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KPTNQ9Y664 436 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 H0YAE9 185 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FCN3O75636 299 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRDX2P32119 198 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTCP1P56278 107 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CAV3P56539 151 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BAMBIQ13145 260 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UTS2BQ765I0 119 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BATF2Q8N1L9 274 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNRF1Q8ND25 227 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAAF1Q8NEP3 725 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GATAD2BQ8WXI9 593 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPSB1Q96BD6 273 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SDSLQ96GA7 329 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CEP19Q96LK0 163 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DMRTB1Q96MA1 342 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 JAM3Q9BX67 310 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR14J1Q9UGF5 321 aa16.34■□□□□ 0.21
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERICH4A6NGS2 130 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MMP9P14780 707 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATF1P18846 271 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BLMHQ13867 455 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BRD3OSQ6XYD6 125 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC25A26Q70HW3 274 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MKXQ8IYA7 352 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF561Q8N587 486 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIR3DL3Q8N743 410 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LY6G5BQ8NDX9 201 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR51A4Q8NGJ6 313 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LHX4Q969G2 390 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZDHHC16Q969W1 377 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLAMF9Q96A28 289 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBX15Q96SF7 602 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SIRPDQ9H106 197 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF222Q9UK12 451 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DHDHQ9UQ10 334 aa16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 INMTO95050 263 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZFPL1O95159 310 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KNG1P01042 644 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LIMS3P0CW19 117 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LIMS4P0CW20 117 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 POU3F4P49335 361 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC34A1Q06495 639 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 Q8IYB0 196 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR5D14Q8NGL3 314 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR10AC1Q8NH08 325 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM216AQ8WUB2 273 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM80Q96HE8 168 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OPALINQ96PE5 141 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF649Q9BS31 505 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAB21L2Q9Y586 359 aa16.32■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A0A1W2PPH5 198 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EFCAB10A6NFE3 127 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 E9PI62 339 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ETV1P50549 477 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC58Q4VC31 144 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VMO1Q7Z5L0 202 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SERPINA12Q8IW75 414 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM185AQ8N0U4 392 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CD177Q8N6Q3 437 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR13C9Q8NGT0 318 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C8orf46Q8TAG6 207 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HES4Q9HCC6 221 aa16.31■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GNAO1P09471 354 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERVK11-1P61568 191 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UBA52P62987 128 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZDHHC22Q8N966 263 aa16.3■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms