RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 MYDGFQ969H8 173 aa10.88□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.88□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 TMIGD2Q96BF3 282 aa10.88□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 SDSLQ96GA7 329 aa10.88□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 BCL7BQ9BQE9 202 aa10.88□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF747Q9BV97 191 aa10.88□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF222Q9UK12 451 aa10.88□□□□□ -0.67
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C9orf3-210ENST00000462125 MAB21L2Q9Y586 359 aa10.88□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 PQLC2LA1A4F0 135 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.87□□□□□ -0.67
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C9orf3-210ENST00000462125 RGS10O43665 173 aa10.87□□□□□ -0.67
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C9orf3-210ENST00000462125 GMFBP60983 142 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 SLC35A2P78381 396 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 OCLNQ16625 522 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 PRSS48Q7RTY5 328 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 SPARTQ8N0X7 666 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 Q8N7P7 452 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 POC1AQ8NBT0 407 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC54Q8NEL0 328 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 CNIH3Q8TBE1 160 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 NPRL2Q8WTW4 380 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 TBX5Q99593 518 aa10.87□□□□□ -0.67
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C9orf3-210ENST00000462125 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 CEPT1Q9Y6K0 416 aa10.87□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 IRGMA1A4Y4 181 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 SNTNA6NMZ2 147 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 POM121CA8CG34 1229 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 J3QT63 122 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 SYNGR1O43759 233 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 APOL3O95236 402 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 TFF1P04155 84 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 MELTFP08582 738 aa10.86□□□□□ -0.67
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C9orf3-210ENST00000462125 HAAOP46952 286 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF85Q03923 595 aa10.86□□□□□ -0.67
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C9orf3-210ENST00000462125 ACP7Q6ZNF0 438 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 VMO1Q7Z5L0 202 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 CMTM4Q8IZR5 234 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 ZNRF1Q8ND25 227 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 OR10H4Q8NGA5 316 aa10.86□□□□□ -0.67
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C9orf3-210ENST00000462125 GPR173Q9NS66 373 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 POMT1Q9Y6A1 747 aa10.86□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 A6NIN4 97 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 RFPL4AA6NLU0 287 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 SYT7O43581 403 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 ENTPD6O75354 484 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 WBP4O75554 376 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 PIPP12273 146 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 GABRA2P47869 451 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 TMBIM6P55061 237 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 ERVK11-1P61568 191 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 NEDD8Q15843 81 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 LAIR2Q6ISS4 152 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 PRSS35Q8N3Z0 413 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 OR13F1Q8NGS4 319 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 MUL1Q969V5 352 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 C10orf35Q96D05 121 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 NRIP2Q9BQI9 281 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC90BQ9GZT6 254 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 ONECUT1Q9UBC0 465 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 MMP24Q9Y5R2 645 aa10.85□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0U1RQK1 487 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 ANKRD61A6NGH8 418 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 PTGES3LE9PB15 166 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 M0R1W7 72 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 XPNPEP2O43895 674 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFB7P17568 137 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 GABRB1P18505 474 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 DCKP27707 260 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 PRDX2P32119 198 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 IER3P46695 156 aa10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 RPL15P61313 204 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
C9orf3-210ENST00000462125 GUCA2AQ02747 115 aa10.84□□□□□ -0.67
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