RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 KIR2DS4P43632 304 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 LGALS4P56470 323 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 CXCR4P61073 352 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF273Q14593 569 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 AANATQ16613 207 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 PLA1AQ53H76 456 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM42Q69YG0 159 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 ANGPTL5Q86XS5 388 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB18Q9NP72 206 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 USE1Q9NZ43 259 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 POMPQ9Y244 141 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 V9GYS6 101 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 MEGF11A6BM72 1044 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 TK1P04183 234 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB13P51153 203 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 DLX6P56179 175 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 ODF4Q2M2E3 257 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 C11orf88Q6PI97 169 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 CALHM1Q8IU99 346 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 PIFOQ8TCI5 191 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 TBX5Q99593 518 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 HES4Q9HCC6 221 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT84Q9NSB2 600 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 CLN6Q9NWW5 311 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 F8VVB4 439 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 F8VWA3 439 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 G3V4G9 280 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 K7N7A8 449 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 INMTO95050 263 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 APOL3O95236 402 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 ARG1P05089 322 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 MPZP25189 248 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 ACTR3P61158 418 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 ERVK11-1P61568 191 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 EFNB1P98172 346 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 COL10A1Q03692 680 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM189A2Q15884 450 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 C12orf73Q69YU5 71 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 SSX6Q7RTT6 188 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 LYG1Q8N1E2 194 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM163Q8TC26 289 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 CFHR4Q92496 578 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 MNTQ99583 582 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF702PQ9H963 129 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 ZAR1LA6NP61 321 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 C17orf98A8MV24 154 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 VGLL3A8MV65 326 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 G3V2T6 193 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 SYT7O43581 403 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF737O75373 536 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 OPN1MWP04001 364 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT8P05787 483 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF728P0DKX0 622 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 CCL1P22362 96 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 EDDM3BP56851 147 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 IL24Q13007 206 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 UBE2V2Q15819 145 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP6AP1Q15904 470 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-206ENST00000446904 SSX2Q16385 188 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms