RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425388.1

LINC00501-201, long intergenic non-protein coding RNA 501, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00501, Length 2,046 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00501-201ENST00000425388 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FZD2Q14332 565 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ICAM4Q14773 271 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CDKN3Q16667 212 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RLN3Q8WXF3 142 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TOMM40LQ969M1 308 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF479Q96JC4 524 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZBP1Q9H171 429 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CST9LQ9H4G1 147 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GP6Q9HCN6 339 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 LHX3Q9UBR4 397 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RNF24Q9Y225 148 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 A0A1W2PR48 441 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SCDO00767 359 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GRM6O15303 877 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CTSVO60911 334 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 UPK3AO75631 287 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CLDN7O95471 211 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TYMSP04818 313 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 HRH1P35367 487 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FLT3LGP49771 235 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FHITP49789 147 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PRKAG1P54619 331 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MESP2Q0VG99 397 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GPR18Q14330 331 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 P2RY6Q15077 328 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GLYATL1Q969I3 302 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 Q9N2K0 584 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CKLFQ9UBR5 152 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FUT9Q9Y231 359 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 C9orf172C9J069 976 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 YPEL1O60688 119 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CEACAM1P13688 526 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CTGFP29279 349 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CSNK1A1P48729 337 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RHOAP61586 193 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RHOGP84095 191 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SPEM2Q0P670 501 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MALLQ13021 153 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF266Q14584 549 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 NRN1LQ496H8 165 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TCF24Q7RTU0 167 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GRHL3Q8TE85 626 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM230Q96A57 120 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SDSLQ96GA7 329 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CAPNS2Q96L46 248 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 Q96M85 177 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 IL17FQ96PD4 163 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 YPEL2Q96QA6 119 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR5B12Q96R08 314 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GABRG3Q99928 467 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 NUDT9Q9BW91 350 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.21□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PLPP1O14494 284 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 SCGB1A1P11684 91 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 MSR1P21757 451 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 ACP1P24666 158 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 CD27P26842 260 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms