RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2AE1Q8NHA4 323 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 FAAP24Q9BTP7 215 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 DCHS1Q96JQ0 3298 aa16.29■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 MSTNO14793 375 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 NR2C1P13056 603 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 OPRM1P35372 400 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 MTCP1P56278 107 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SMCO1Q147U7 214 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TAF9Q16594 264 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 GGNBP1Q5YKI7 109 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 NAXEQ8NCW5 288 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 C2CD4CQ8TF44 421 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TOMM40LQ969M1 308 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 C9JQL5 133 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 DHHO43323 396 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CST4P01036 141 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SULT1A2P50226 295 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF84P51523 738 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM33P57088 247 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf128Q5T292 105 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 RXFP4Q8TDU9 374 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 LIME1Q9H400 295 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PADI1Q9ULC6 663 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF318Q5VUA4 2279 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CD63P08962 238 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL6IP1Q15041 203 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF528Q3MIS6 628 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SP6Q3SY56 376 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SHEQ5VZ18 495 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM268Q5VZI3 342 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZRG5 221 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFP82Q8N141 532 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM54Q969K7 222 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 Q96M66 194 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ANXA10Q9UJ72 324 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 DEDDO75618 318 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNA21P01568 189 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CRYBA1P05813 215 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5H8P0DN80 308 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SPP1P10451 314 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SGK3Q96BR1 496 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO17Q96EF6 278 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PRRX2Q99811 253 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 F10P00742 488 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ACKR3P25106 362 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 BTNL8Q6UX41 500 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SULT4A1Q9BR01 284 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ULBP2Q9BZM5 246 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF98A6NK75 572 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF850A8MQ14 1090 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FCGR3AP08637 254 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CCL3P10147 92 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM76BQ5HYJ3 339 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 BRICD5Q6PL45 260 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 OR9K2Q8NGE7 335 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC39A7Q92504 469 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DYRK2Q92630 601 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP250Q9BV73 2442 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 YKT6O15498 198 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 UMODP07911 640 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 OR8U9P0C7N5 309 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 GLI4P10075 376 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGPP57054 158 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 RSU1Q15404 277 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 RTL6Q6ICC9 239 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM123Q8N131 208 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 OR8U1Q8NH10 309 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SPTSSAQ969W0 71 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 AK3Q9UIJ7 227 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 AMDHD2Q9Y303 409 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 RRP8O43159 456 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FXYD4P59646 89 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 AVPI1Q5T686 147 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ETV3LQ6ZN32 361 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ERGIC1Q969X5 290 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 MED13Q9UHV7 2174 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DOCK10Q96BY6 2186 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM221AA4D161 298 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CA11O75493 328 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms