RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 COMMD4Q9H0A8 199 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CLEC2DQ9UHP7 191 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF222Q9UK12 451 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MAB21L2Q9Y586 359 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TOX4O94842 621 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MYL12AP19105 171 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKACBP22694 351 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 RBP2P50120 134 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP1B3P54709 279 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MTCP1P56278 107 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVK11-1P61568 191 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM21Q3B7S5 101 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2G6Q5TZ20 316 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 PHC2Q8IXK0 858 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CD177Q8N6Q3 437 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNRF1Q8ND25 227 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 FBLIM1Q8WUP2 373 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SDSLQ96GA7 329 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 WDFY2Q96P53 400 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 DCTN5Q9BTE1 182 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 HES4Q9HCC6 221 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 BABAM2Q9NXR7 383 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MTCH1Q9NZJ7 389 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 INMTO95050 263 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 PLATP00750 562 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SFTPBP07988 381 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MMP9P14780 707 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFB7P17568 137 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 HILS1P60008 231 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ST3GAL4Q11206 333 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MED21Q13503 144 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC58Q4VC31 144 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL11BQ5VVY1 283 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A26Q70HW3 274 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA3Q8NHX4 192 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 GATAD2BQ8WXI9 593 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 EFCAB10A6NFE3 127 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 H0YJX3 145 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 XPNPEP2O43895 674 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 OCM2P0CE71 109 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CAV3P56539 151 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 XAF1Q6GPH4 301 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SERPINA12Q8IW75 414 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5D14Q8NGL3 314 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SLAMF9Q96A28 289 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP19Q96LK0 163 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 DMRTB1Q96MA1 342 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 JMJD8Q96S16 334 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TBX15Q96SF7 602 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 C19orf24Q9BVV8 132 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SIRPDQ9H106 197 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 DHDHQ9UQ10 334 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 COL6A5A8TX70 2615 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV40A0A0B4J280 105 aa17.41■□□□□ 0.38
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SH3BP4-204ENST00000416021 F8VWA3 439 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MT-ND2P03891 347 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 PIPP12273 146 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TUSC1Q2TAM9 212 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 MKXQ8IYA7 352 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF561Q8N587 486 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM185AQ8NFB2 350 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 C8orf46Q8TAG6 207 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SPSB1Q96BD6 273 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 OR14J1Q9UGF5 321 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 KPTNQ9Y664 436 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 OGG1O15527 345 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 KNG1P01042 644 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CAPZA1P52907 286 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 AQP4P55087 323 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK5R1Q15078 307 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 PDCD1Q15116 288 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR157Q5UAW9 335 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 C9orf139Q6ZV77 190 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 PARP16Q8N5Y8 322 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 OR13C9Q8NGT0 318 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 OR52N1Q8NH53 320 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 OPALINQ96PE5 141 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 ONECUT1Q9UBC0 465 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 DOCK11Q5JSL3 2073 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-204ENST00000416021 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa17.39■□□□□ 0.37
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