RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 IL18R1Q13478 541 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 SHFQ7M4L6 423 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 OR9Q2Q8NGE9 314 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 SESN1Q9Y6P5 492 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 GSTT1P30711 240 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 BRS3P32247 399 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ECI1P42126 302 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 HAAOP46952 286 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 RAB25P57735 213 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 THEM6Q8WUY1 208 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 PYURFQ96I23 114 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 NRIP2Q9BQI9 281 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC7AQ9BXN2 247 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM133Q9H2Q1 129 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 HES4Q9HCC6 221 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 PALMDQ9NP74 551 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 TAS2R1Q9NYW7 299 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A13Q9Y226 551 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 CSMD3Q7Z407 3707 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 FAM183AA6NL82 134 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 J3QT63 122 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF737O75373 536 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 MMP23AO75900 390 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 LYNP07948 512 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 CGB2Q6NT52 195 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 BTBD10Q9BSF8 475 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 NIPAL2Q9H841 368 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ZFP57Q9NU63 452 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 DPM3Q9P2X0 92 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 HHLA2Q9UM44 414 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 GASTP01350 101 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 COX4I1P13073 169 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 OR3A4PP47883 348 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 SBSPONQ8IVN8 264 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 TPRX1Q8N7U7 411 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 RAX2Q96IS3 184 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 MYLK2Q9H1R3 596 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 SLC6A1P30531 599 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 EDDM3AQ14507 147 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 C9orf66Q5T8R8 295 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF573Q86YE8 665 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 OTOSQ8NHW6 89 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ABCD2Q9UBJ2 740 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00527Q9UJ94 153 aa15.22■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 CCL24O00175 119 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 SELENOFO60613 162 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 NRASP01111 189 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 GP2P55259 537 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ERVK11-1P61568 191 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 PLBD1Q6P4A8 553 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF695Q8IW36 515 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 OR8H2Q8N162 312 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 OTULINQ96BN8 352 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 SCOCQ9UIL1 159 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 PIGLQ9Y2B2 252 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0U1RQV5 110 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 hADV38S2A0JD32 116 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM82A0PJX8 343 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFAB1O14561 156 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 GSC2O15499 205 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 SOX14O95416 240 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 IFNGP01579 166 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV3-1P01715 115 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 FABP3P05413 133 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 SNAPC1Q16533 368 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 COMMD2Q86X83 199 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ABHD12Q8N2K0 398 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 RNF148Q8N7C7 305 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 OR2T33Q8NG76 320 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 MCUR1Q96AQ8 359 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 CDRT15Q96T59 188 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 OR51V1Q9H2C8 321 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 GORASP2Q9H8Y8 452 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 GPR84Q9NQS5 396 aa15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms