RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 PIK3IP1Q96FE7 263 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM68Q96MH6 324 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 TAAR9Q96RI9 348 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 ADOQ96SZ5 270 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 NUDT9Q9BW91 350 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 ARV1Q9H2C2 271 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 TCFL5Q9UL49 500 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 ACKR3P25106 362 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 OR9A4Q8NGU2 314 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 KLHDC7BQ96G42 594 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 TLNRD1Q9H1K6 362 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 KCNIP1Q9NZI2 227 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 MTCH1Q9NZJ7 389 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 HSF4Q9ULV5 492 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 GPANK1O95872 356 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 IGKV1D-16P01601 117 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF43P17038 809 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 IL15RAQ13261 267 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 SLC25A28Q96A46 364 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 LANCL2Q9NS86 450 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 OBSL1O75147 1896 aa4.84□□□□□ -1.64
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PTPRD-205ENST00000397611 CCL1P22362 96 aa4.84□□□□□ -1.64
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PTPRD-205ENST00000397611 HIST1H3AP68431 136 aa4.84□□□□□ -1.64
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PTPRD-205ENST00000397611 HBG2P69892 147 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 SRPXP78539 464 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 HLA-DRB3P79483 266 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 DLK1P80370 383 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 AQP3Q92482 292 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 AQP10Q96PS8 301 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 GGACTQ9BVM4 153 aa4.84□□□□□ -1.64
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PTPRD-205ENST00000397611 TUBA4BQ9H853 241 aa4.84□□□□□ -1.64
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PTPRD-205ENST00000397611 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRD-205ENST00000397611 TSPAN32Q96QS1 320 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 MFNGO00587 321 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 TSPAN2O60636 221 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF217O75362 1048 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 TK1P04183 234 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 OR1D4P47884 311 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 OR5I1Q13606 314 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRD-205ENST00000397611 MOGAT1Q96PD6 335 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRD-205ENST00000397611 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
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PTPRD-205ENST00000397611 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 SLC25A53Q5H9E4 307 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 LHFPL1Q86WI0 220 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 LRRC18Q8N456 261 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 DTD1Q8TEA8 209 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 DYRK2Q92630 601 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 PLEK2Q9NYT0 353 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 CLCF1Q9UBD9 225 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 GPR132Q9UNW8 380 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-205ENST00000397611 LIPGQ9Y5X9 500 aa4.83□□□□□ -1.64
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