RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC88CQ9P219 2028 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 M0R1X1 148 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV1D-16P01601 117 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 AKR1C3P42330 323 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 HIST2H3AQ71DI3 136 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 UCN2Q96RP3 112 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CLLU1Q5K131 121 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RHOFQ9HBH0 211 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 DEFB108AA8MXU0 73 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SFT2D2O95562 160 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CRYABP02511 175 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PLA2G10O15496 165 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 DTYMKP23919 212 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CEACAM6P40199 344 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2G1P62253 170 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ZXDAP98168 799 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 C3AR1Q16581 482 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS53Q2L4Q9 553 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ZPLD1Q8TCW7 415 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ST6GAL2Q96JF0 529 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF75AQ96N20 296 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SOCS1O15524 211 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAP1O75689 374 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SULT1A3P0DMM9 295 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SULT1A4P0DMN0 295 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PNLIPP16233 465 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 DEFA6Q01524 100 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CLEC3BP05452 202 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB13P51153 203 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 Q8IYB0 196 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A6P12236 298 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SMIM15Q7Z3B0 74 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS42Q7Z5A4 293 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 WFDC6Q9BQY6 131 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR13Q9H1Z4 485 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 MPC2O95563 127 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A4P12235 298 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CXCL3P19876 107 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SPICQ8N5J4 248 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CORO2AQ92828 525 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 GNB4Q9HAV0 340 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB18Q9NP72 206 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ISXQ2M1V0 245 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 OR13G1Q8NGZ3 307 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TAAR6Q96RI8 345 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 MYOFQ9NZM1 2061 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS27Q9BQR3 290 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 NIT2Q9NQR4 276 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TMED3Q9Y3Q3 217 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 BGLAPP02818 100 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF79Q15937 498 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 M1APQ8TC57 530 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ASB5Q8WWX0 329 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 AKR1E2Q96JD6 320 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAM20O43506 726 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 MLF1P58340 268 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2G2P60604 165 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CABLES2Q9BTV7 478 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 RASL12Q9NYN1 266 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 CLEC1BQ9P126 229 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TUBAL3A6NHL2 446 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PTP4A3O75365 173 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 MICBQ29980 383 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 C4orf17Q53FE4 359 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 TUSC5Q8IXB3 177 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5M8Q8NGP6 311 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 NMES1Q9C002 83 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR13Q9NZ81 148 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 K7EQM0 130 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-202ENST00000392011 HPXP02790 462 aa15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms