RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373387.8

GARNL3-202, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GARNL3, Length 3,800 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-202ENST00000373387 LINC00587B1AMM8 73 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 GPR137BO60478 399 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SFTPBP07988 381 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SERPINA2P20848 420 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 MSR1P21757 451 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SMCO1Q147U7 214 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 MIDNQ504T8 468 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 ZNF561Q8N587 486 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 DEFB119Q8N690 84 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SGK3Q96BR1 496 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 C14orf79Q96F83 325 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 PADI1Q9ULC6 663 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SYNGR3O43761 229 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 KNG1P01042 644 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 IL13RA2Q14627 380 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 GUK1Q16774 197 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 LCN10Q6JVE6 187 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 GJC3Q8NFK1 279 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 OR8G5Q8NG78 346 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 FBXO17Q96EF6 278 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 U3KQA8 63 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 OR2J2O76002 312 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 IGKV1D-12P01611 117 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 IGHV2-70P01814 119 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 CYC1P08574 325 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 FCGR2AP12318 317 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 FHITP49789 147 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 RHEBQ15382 184 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 CARD17Q5XLA6 110 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 LRRC18Q8N456 261 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 Q8NFD4 153 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 RASL10BQ96S79 203 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 PCSK5Q92824 1860 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 OR5AC1P0C628 307 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 OR5H8P0DN80 308 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 RAB5CP51148 216 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 PIGPP57054 158 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SLC35A1P78382 337 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 TGIF1Q15583 401 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 Q6ZS49 121 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SPSB1Q96BD6 273 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 MOB3AQ96BX8 217 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 IFNA21P01568 189 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 DBHP09172 617 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 MYF5P13349 255 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 RAB5AP20339 215 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 PPT1P50897 306 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 EXT1Q16394 746 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 PGAM5Q96HS1 289 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 BOD1Q96IK1 185 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 A0A1W2PPH5 198 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 A6NLC8 198 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 IFITM10A6NMD0 228 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 AGPAT2O15120 278 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-202ENST00000373387 OPN1LWP04000 364 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms