RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-202ENST00000373162 SYT7O43581 403 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF737O75373 536 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 KNG1P01042 644 aa14.68□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-202ENST00000373162 SAA4P35542 130 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 RAG2P55895 527 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 DLX6P56179 175 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC29A1Q99808 456 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 FRRS1LQ9P0K9 344 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 AASSQ9UDR5 926 aa14.68□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-202ENST00000373162 MEGF11A6BM72 1044 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ISG15P05161 165 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 FBP1P09467 338 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 KRTAP10-3P60369 221 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ACTC1P68032 377 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ACTA1P68133 377 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ACSM1Q08AH1 577 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ODF4Q2M2E3 257 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 RDH10Q8IZV5 341 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 RNFT2Q96EX2 444 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 H3BSH0 61 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC16A6O15403 523 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 NXPH2O95156 264 aa14.66□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-202ENST00000373162 TK1P04183 234 aa14.66□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-202ENST00000373162 OR12D2P58182 307 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF91Q05481 1191 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF273Q14593 569 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.66□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-202ENST00000373162 TCF23Q7RTU1 214 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 BATF2Q8N1L9 274 aa14.66□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-202ENST00000373162 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.66□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-202ENST00000373162 C17orf50Q8WW18 174 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 PP6455Q8WZ26 134 aa14.66□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-202ENST00000373162 PELI1Q96FA3 418 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 CITED1Q99966 193 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 S100A14Q9HCY8 104 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 GNG8Q9UK08 70 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1W2PQ09 198 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 K7N7A8 449 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 FUT6P51993 359 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 PROK1P58294 105 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 LINC01006Q8NI28 216 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-202ENST00000373162 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1W2PRD5 423 aa14.64□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1W2PRM7 423 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC1A7O00341 560 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCL3L1P16619 93 aa14.64□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-202ENST00000373162 ATP6V1E1P36543 226 aa14.64□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-202ENST00000373162 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 MIDNQ504T8 468 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 Q6ZSV7 163 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 MKXQ8IYA7 352 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 ACBD7Q8N6N7 88 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-202ENST00000373162 APH1BQ8WW43 257 aa14.64□□□□□ -0.07
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