RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF124Q15973 351 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SSX2Q16385 188 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ACKR1Q16570 336 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR4C3Q8NH37 302 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLAMF9Q96A28 289 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 S100PBPQ96BU1 408 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GALNT14Q96FL9 552 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 AMELYQ99218 206 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PR64 198 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PRV1 198 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR2W5A6NFC9 320 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TLCD2A6NGC4 264 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 H7C1C5 153 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 J3KRW8 73 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HSPA12AO43301 675 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FOXS1O43638 330 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DUX1O43812 170 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HBE1P02100 147 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CFIP05156 583 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SFTPBP07988 381 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GP1BBP13224 206 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GNB3P16520 340 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF708P17019 499 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PI4KAP42356 2102 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SPCS3P61009 180 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 LCN6P62502 163 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 UNC119Q13432 240 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ARFRP1Q13795 201 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KCNAB1Q14722 419 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MED25Q71SY5 747 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A45Q8N413 288 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TAAR8Q969N4 342 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM230Q96A57 120 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR10C1Q96KK4 312 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SSX3Q99909 188 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PPE3 182 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 AHSA1O95433 338 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 AMY1AP04745 511 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RAB4AP20338 218 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MALP21145 153 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DDTP30046 118 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 THBS4P35443 961 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CEACAM6P40199 344 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NPY4RP50391 375 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SRPXP78539 464 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-BQ31612 363 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PYY3Q5JQD4 70 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF383Q8NA42 475 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SAP25Q8TEE9 199 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NAT6Q93015 286 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FGGYQ96C11 551 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MUCL1Q96DR8 90 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 LURAP1Q96LR2 239 aa6.3□□□□□ -1.4
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