RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC45Q96CN5 670 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR21Q99679 349 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-202ENST00000370826 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC38A1Q9H2H9 487 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-202ENST00000370826 IL20Q9NYY1 176 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-202ENST00000370826 VAPAQ9P0L0 249 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMD13Q9UNM6 376 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-202ENST00000370826 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-202ENST00000370826 ACOT9Q9Y305 439 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-202ENST00000370826 HES2Q9Y543 173 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-202ENST00000370826 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 NID2Q14112 1375 aa1.84□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 HACD1B0YJ81 288 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 PLPP3O14495 311 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 SGCEO43556 437 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC16A7O60669 478 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAPPC6AO75865 159 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 GATBO75879 557 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 MYO1DO94832 1006 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 AHSA1O95433 338 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV2-8P01709 118 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 GP1BAP07359 652 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 RHOCP08134 193 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB5AP20339 215 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXA6P31267 233 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 PCK1P35558 622 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 TGFBR1P36897 503 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 TAS2R60P59551 318 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2G2P60604 165 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 VSNL1P62760 191 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 IFITM3Q01628 133 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 C2orf80Q0P641 193 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4D1Q15615 310 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFAF6Q330K2 333 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 LUZP6Q538Z0 58 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL12Q53G59 568 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 RESP18Q5W5W9 173 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 DUPD1Q68J44 220 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS54Q6PEW0 395 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 UNC93AQ86WB7 457 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 NELFCDQ8IXH7 590 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 STK40Q8N2I9 435 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 DRAM1Q8N682 238 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf64Q8NEQ6 169 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 DCAKDQ8WVC6 231 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR82Q96P67 336 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 ALS2CR12Q96Q35 445 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF251Q9BRH9 671 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 MARVELD1Q9BSK0 173 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 SPZ1Q9BXG8 430 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 POTEKPQ9BYX7 375 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00574Q9H8X3 128 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR54Q9H977 334 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC42Q9Y546 428 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa1.83□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 PEG3Q9GZU2 1588 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0B4J2E0 115 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 K7EN84 100 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 MANBAO00462 879 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 CD40LGP29965 261 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 KDELR2P33947 212 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 ARR3P36575 388 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 MPV17P39210 176 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEA6P43360 314 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 IDH2P48735 452 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 BLVRAP53004 296 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 HCCSP53701 268 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 NAB1Q13506 487 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM53BQ14153 422 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 TFDP2Q14188 446 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 TAL2Q16559 108 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 SPIN3Q5JUX0 258 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTL10Q5JWF8 245 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 CPTPQ5TA50 214 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 MFSD14CQ5VZR4 134 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 MED27Q6P2C8 311 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM136Q6ZRR5 245 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 PLCZ1Q86YW0 608 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 DAW1Q8N136 415 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF738Q8NE65 137 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 OR51A7Q8NH64 312 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2E2Q96LR5 201 aa1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF75AQ96N20 296 aa1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms