RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 MOGAT3Q86VF5 341 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 BATF2Q8N1L9 274 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ACBD4Q8NC06 268 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CHST4Q8NCG5 386 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 OR4M1Q8NGD0 313 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 OR56B1Q8NGI3 324 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 HPS1Q92902 700 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A38Q96DW6 304 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RAB1BQ9H0U4 201 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC18AA5D8T8 446 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC30A6NM36 301 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 H3BUI4 141 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 LDLRAD4O15165 306 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RHBDL1O75783 438 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV1D-12P01611 117 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 GLRA1P23415 457 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 GABRR1P24046 479 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.765e-6■■□□□ 13.3
PTPRK-201ENST00000368202 MNDAP41218 407 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NR4A2P43354 598 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 VEGFCP49767 419 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 EFNB2P52799 333 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SNU13P55769 128 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 GMFBP60983 142 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FGF12P61328 243 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 UNC119Q13432 240 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MADCAM1Q13477 382 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MPPED2Q15777 294 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SWI5Q1ZZU3 235 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC18BQ6UXF7 455 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 C1orf87Q8N0U7 546 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 FAM58AQ8N1B3 248 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 DTX3Q8N9I9 347 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 POC1AQ8NBT0 407 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC18CQ8NCF0 446 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM104Q8NE00 496 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 OR10Z1Q8NGY1 313 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC29Q8WV35 223 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TLNRD1Q9H1K6 362 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 AKIP1Q9NQ31 210 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MTCH1Q9NZJ7 389 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 DNAJB11Q9UBS4 358 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ST3GAL6Q9Y274 331 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RELNP78509 3460 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV18A0A075B6X5 111 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PP11 408 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 IFNL4K9M1U5 179 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 AKR7A2O43488 359 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 XRCC3O43542 346 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PGA5P0DJD9 388 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CDK2P24941 298 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ETV6P41212 452 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 GATA4P43694 442 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NPBWR2P48146 333 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 INPP1P49441 399 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RBM11P57052 281 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 QRFPP83859 136 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PLA2G7Q13093 441 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ARL6IP1Q15041 203 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MST1LQ2TV78 715 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ELP2Q6IA86 826 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 WDR82Q6UXN9 313 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF826PQ6ZT77 177 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00596Q86U02 117 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 IZUMO1Q8IYV9 350 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 OR10R2Q8NGX6 335 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 POM121Q96HA1 1249 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF488Q96MN9 340 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NEDD4LQ96PU5 975 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 LPAR5Q9H1C0 372 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RASL12Q9NYN1 266 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 RNF7Q9UBF6 113 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 LAMP3Q9UQV4 416 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NBASA2RRP1 2371 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PCNX1Q96RV3 2341 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SFTPBP07988 381 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CD40LGP29965 261 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PPP5CP53041 499 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TAS2R20P59543 309 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SCN1BQ07699 218 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 IKZF1Q13422 519 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MPV17LQ2QL34 196 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM21Q3B7S5 101 aa10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.9 ms